典型文献
川、渝、黔地区猪圆环病毒3型PCR检测及全基因组序列分析
文献摘要：
为了解川、渝、黔地区猪圆环病毒3型(PCV3)的感染现状及流行毒株的分子遗传特征,本试验对2020年1月至2021年1月期间3省市共30个区县639份临床样本进行了检测,对阳性样本进行全基因组测序并与国内外毒株比对分析.结果显示,共检测到7份阳性样本,整体阳性率1.10％.5份阳性样本(重庆3份、四川1份、贵州1份)经过测序拼接,发现病毒全基因组长度均为2 000 bp,GenBank登录号分别为OK334614～OK334618,同源性比对显示与国内外毒株的相似性在98.2％～99.2％之间,与PCV2和PCV4的同源性较低,分别为44.9％～45.5％和46.3％～46.9％.通过对Cap蛋白的氨基酸序列分析,发现重庆和四川地区4份样本感染毒株的基因型均属于PCV3a型,而贵州地区样本感染毒株的第24和27位氨基酸分别为亮氨酸(L)和赖氨酸(K),为一种新的变异基因型,不属于目前分类标准下的任何一种.该结果为进一步了解PCV3的遗传变异及其在我国西南部分省份的分子流行特征提供了依据.
文献关键词：
猪圆环病毒3型;流行病学调查;全基因组;基因型
中图分类号：
作者姓名：
杨晓伟;赵自亮;付雨;涂少宇;刘霞;李照伟;浦同灿;王慧;曾红;赵光伟
作者机构：
西南大学动物医学院,重庆荣昌402460;贵州省动物疫病预防控制中心,贵州贵阳550008;贵州省花溪区动物疫病预防控制中心,贵州 贵阳550008
文献出处：
引用格式：
[1]杨晓伟;赵自亮;付雨;涂少宇;刘霞;李照伟;浦同灿;王慧;曾红;赵光伟-.川、渝、黔地区猪圆环病毒3型PCR检测及全基因组序列分析)[J].中国兽医学报,2022(05):846-852,861
A类：
OK334614,OK334618
B类：
猪圆环病毒,全基因组序列分析,感染现状,流行毒株,分子遗传,遗传特征,区县,临床样本,阳性样本,全基因组测序,比对分析,体阳,拼接,组长,bp,GenBank,登录号,同源性,PCV2,PCV4,Cap,氨基酸序列,四川地区,染毒,基因型,PCV3a,贵州地区,亮氨酸,赖氨酸,异基因,分类标准,遗传变异,西南部,分省,分子流行特征,流行病学调查
AB值：
0.350805
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