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鸭圆环病毒实时定量PCR检测方法的建立及流行毒株全基因组遗传变异分析
文献摘要：
为了解近年来鸭圆环病毒(duck circovirus,DuCV)的流行现状,本研究在DuCV的Rep基因保守区内设计一对特异性荧光定量引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法.结果显示:该方法最低可检测到拷贝数为3.46×101copies/pL的目的基因,比常规PCR灵敏;选取Ct值最低的阳性样品进行全基因组扩增及进化分析,成功扩增出1 988 bp的病毒全基因,序列分析结果显示该病毒基因型为DuCV-1,亚型为1 b.本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法为DuCV的流行病学调查提供了有效的监测手段,同时通过分析不同基因型的遗传进化特点与Cap蛋白氨基酸位点突变特征,为DuCV感染的防控研究提供参考.
文献关键词：
鸭圆环病毒;基因进化;定量PCR;检测
中图分类号：
作者姓名：
赵韵笛;杨兴淼;李靖红;曹瑞兵
作者机构：
南京农业大学动物医学院,江苏南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]赵韵笛;杨兴淼;李靖红;曹瑞兵-.鸭圆环病毒实时定量PCR检测方法的建立及流行毒株全基因组遗传变异分析)[J].畜牧与兽医,2022(12):98-105
A类：
101copies
B类：
鸭圆环病毒,实时定量,流行毒株,遗传变异分析,duck,circovirus,DuCV,流行现状,Rep,内设,引物,SYBR,Green,拷贝数,pL,目的基因,Ct,全基因组扩增,进化分析,bp,序列分析,病毒基因,流行病学调查,监测手段,不同基因型,遗传进化,Cap,氨基酸位点,位点突变,突变特征,防控研究,基因进化
AB值：
0.37938
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