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新发林麝环状类病毒的鉴定和分析
文献摘要：
利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circovirus-like)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc.其基因组全长约3552 nt,GC含量39.00％,含有2个开放阅读框(ORF),即ORF1和ORF2.其中ORF1长度为1386 nt,ORF2长度为1953 nt.ORF1编码的氨基酸序列与来自猪血清圆环状病毒的(MH170058.1)序列相似度为34.31％.系统进化分析表明其与来自猪的圆环状病毒(MH170058.1)和鸭相关环状病毒(NC_030134.1)为同一进化分支.该病毒是否与林麝特定疾病相关有待于进一步流行病学研究.
文献关键词：
林麝;环状病毒;病毒宏基因组学;基因组结构分析;系统发育分析
中图分类号：
作者姓名：
刘齐;杨世兴;张文;齐敦武;付为国
作者机构：
江苏大学农业工程研究院,镇江212013;江苏大学医学院,镇江212013;成都大熊猫繁育研究基地 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室,成都 610081
文献出处：
引用格式：
[1]刘齐;杨世兴;张文;齐敦武;付为国-.新发林麝环状类病毒的鉴定和分析)[J].中国动物传染病学报,2022(01):39-43
A类：
MH170058
B类：
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AB值：
0.362232
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