典型文献
牛冠状病毒的全基因组测序及遗传进化分析
文献摘要：
为了解热带地区牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)感染情况,对2019年1月～12月云南景洪采集的214份牛食道-咽喉部分泌物(esophagus-pharyngeal secretion,OP液)进行筛查,针对BCoV S蛋白基因片段进行RT-PCR扩增和测序,阳性样品分段扩增病毒全基因序列,进行同源性及遗传进化分析.结果显示,1份牛OP液样品中扩增到BCoV S蛋白基因目的片段622bp,且与中国、越南、美国、瑞典等国家分离的BCoV位于同一分支,属于冠状病毒β属A亚群病毒;全基因组序列分析该毒株与美国毒株US/OH3/2006相似性达到99.33％,二者具有较高的同源性;结构蛋白HE、S、M、N与US/OH3/2006毒株相似性分别为99.29％、99.36％、99.42％和100％,结构蛋白基因主要变异位点在HE基因,其次为S基因.研究结果为进一步开展BCoV分子流行病学以及检测研究提供科学依据.
文献关键词：
牛冠状病毒;全基因组测序;遗传进化分析
中图分类号：
作者姓名：
寇美玲;谢佳芮;杨佳萍;苗海生
作者机构：
云南省畜牧兽医科学院,云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南昆明 650224;施甸县畜牧兽医中心,云南保山 678200
文献出处：
引用格式：
[1]寇美玲;谢佳芮;杨佳萍;苗海生-.牛冠状病毒的全基因组测序及遗传进化分析)[J].动物医学进展,2022(10):1-7
A类：
622bp,OH3
B类：
牛冠状病毒,全基因组测序,遗传进化分析,解热,热带地区,Bovine,coronavirus,BCoV,感染情况,景洪,食道,咽喉部,分泌物,esophagus,pharyngeal,secretion,OP,全基因序列,行同,同源性,扩增到,越南,瑞典,亚群,全基因组序列分析,毒株,US,结构蛋白,HE,变异位点,分子流行病学
AB值：
0.303508
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