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猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析
文献摘要：
旨在分析猪流产胎儿中猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)的感染及其遗传进化情况.对2015-2017年采集的湖南省680份猪流产胎儿病料样品进行PCV3检测、扩增和测序,并利用生物信息学软件对获得的序列进行遗传进化分析.结果显示,猪流产胎儿样品中PCV3阳性率为24.4％(166/680),其中,2015-2017年阳性率分别为18.2％(26/143)、22.7％(54/238)和28.8％(86/299).从PCV3阳性样本中获得了 1株PCV3基因组全长序列,命名为PCV3/CN/Hunan-57(GenBank序列登录号为MZ934695),与国内外毒株基因组序列相比,相似性为97.8％～99.2％;获得了 5株PCV3 ORF2基因序列,它们的核苷酸和氨基酸相似性为97.5％～98.3％和96.7％～99.7％,与国内外参考毒株ORF2基因序列相比,其核苷酸和氨基酸相似性为96.3％～99.2％和96.8％～100％.基于ORF2基因序列构建遗传进化树和进行多重序列比对,发现获得的PCV3阳性序列分别属于PCV3a(1株)和PCV3c(4株),并鉴定出T100A、G113S和A184S突变位点.综上表明,猪流产胎儿中PCV3感染率较高,且存在不同类型的PCV3毒株感染,为后续深入研究PCV3遗传变异及其相关致病性提供了重要参考信息.
文献关键词：
猪圆环病毒3型;全基因组;Cap;遗传演化分析
中图分类号：
作者姓名：
何庆;李周勉;王欢;李丹彤;谭庆辉;邹亚文;苏建明;邓治邦;杨毅;王乃东
作者机构：
湖南农业大学动物医学院兽用蛋白质工程疫苗湖南省重点实验室兽用疫苗逆向创制湖南省工程研究中心,长沙410128;长沙市望城区高塘岭街道农业农村综合服务中心,长沙410128;娄底市动物疫病预防控制中心,娄底417000
文献出处：
引用格式：
[1]何庆;李周勉;王欢;李丹彤;谭庆辉;邹亚文;苏建明;邓治邦;杨毅;王乃东-.猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析)[J].畜牧兽医学报,2022(05):1527-1535
A类：
MZ934695,PCV3c,T100A,G113S,A184S
B类：
流产胎儿,中猪,猪圆环病毒,遗传演化分析,porcine,circovirus,type,利用生物,生物信息学软件,遗传进化分析,阳性样本,基因组全长,CN,Hunan,GenBank,登录号,毒株,基因组序列,ORF2,基因序列,遗传进化树,序列比对,PCV3a,突变位点,感染率,遗传变异,致病性,考信,全基因组,Cap
AB值：
0.245007
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