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15株湖南省猪圆环病毒2型全基因组测序与遗传进化分析
文献摘要：
为了解湖南省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,以PCV2检测阳性样本DNA为模板进行全基因组测序和遗传特征分析.共获得的15株PCV2全基因组,其中10株为PCV2d基因亚型,3株为PCV2b基因亚型,2株为PCV2a基因亚型;15株PCV2全基因组同源性为94.7％～99.9％,与国内外其他PCV2全基因组同源性为93.1％～100％.PCV2a的第77、86～91、151、206和222位,PCV2b的第57、89及210位,PCV2d的第53、68、121、134、215和234位氨基酸与其他亚型存在差异.结果表明,2017—2020年湖南省主要流行PCV2d亚型,不同亚型之间ORF2氨基酸序列差异较大,但同亚型之间氨基酸序列无明显变异.本研究为湖南省PCV2研究及该病防治提供了数据支撑.
文献关键词：
猪圆环病毒2型;全基因扩增;遗传进化分析;湖南
中图分类号：
作者姓名：
何世成;王紫微;丁朝阳;胡巧云;唐小明;王卫国;谢怡灵;王昌建
作者机构：
湖南省动物疫病预防控制中心,湖南长沙 410014;衡阳技师学院,湖南衡阳 421101;娄底市动物疫病预防控制中心,湖南娄底 417000
文献出处：
引用格式：
[1]何世成;王紫微;丁朝阳;胡巧云;唐小明;王卫国;谢怡灵;王昌建-.15株湖南省猪圆环病毒2型全基因组测序与遗传进化分析)[J].中国动物检疫,2022(02):33-39,81
A类：
B类：
猪圆环病毒,全基因组测序,遗传进化分析,遗传变异,变异情况,阳性样本,遗传特征分析,共获,PCV2d,基因亚型,PCV2b,PCV2a,同源性,不同亚型,ORF2,氨基酸序列,序列差异,全基因扩增
AB值：
0.235632
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