典型文献
野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析
文献摘要:
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国家猪中首次检测到,并发现其可能与多系统呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征疾病有关.为了解该病毒在野猪中的流行和遗传进化特征,本研究采集江西省山区野猪组织样品25份,包含淋巴结、肾脏、脾脏,采用探针法荧光定量PCR(TaqMan qPCR)对组织样品检测,对PCV4阳性组织样品采用普通PCR扩增其Cap基因并分析其同源性及遗传进化关系.结果显示,25份样品中检测到3份PCV4阳性样品,检出率为12%(3/25);普通PCR扩增结果显示,在3份阳性样品中均扩增到约1 300 bp的目的条带,测序后的序列比对分析结果显示其均为PCV4全长Cap基因序列(JXNC-2020、JXYC-2020及JXGZ-2020).Cap基因的同源性分析显示,3个野猪源PCV4 Cap基因序列间的同源性为98.69%~100%,氨基酸序列间的同源性为97.1%~100%;与韩国野猪源PCV4流行株E115Cap基因序列的同源性为98.11%~98.54%,氨基酸序列的同源性为96.93%~98.25%;与国内家猪源PCV4 Cap基因序列的同源性为98.54%~99.13%,氨基酸序列同源性97.37%~99.12%;与E115株相比,本研究获得的3个PCV4Cap蛋白氨基酸序列分别存在3个及7个突变氨基酸.与国内PCV4相比,PCV4 Cap基因JXGZ-2020编码的氨基酸序列突变数明显少于其与韩国流行株相比.Cap基因的系统发育分析显示,野猪源PCV4与家猪源PCV4同属于一个分支,与圆环病毒属其他病毒处于不同分支.上述结果表明,野猪源PCV4与家猪源PCV4的亲缘关系较近,间接表明野猪可以促进PCV4的扩散与传播.本研究结果首次拓展了 PCV4的宿主范围,为进一步研究PCV4的流行及基因组特征提供参考.
文献关键词:
野猪;家猪;猪圆环病毒4型;Cap基因;遗传进化分析
中图分类号:
作者姓名:
吴欢生;王飞兵;杨艳;周光斌;陈晨;徐田放;周贝怡;陈依婷;薛美佳;曹华斌
作者机构:
江西省畜禽疫病诊断与防控重点实验室/江西农业大学动物群发性疾病监测与防治研究所,江西 南昌 330045;江西省金溪县农业农村局农业技术推广中心,江西 抚州 344800;江西省农业技术推广中心,江西 南昌 330096;江西省丰城市农业农村局,江西 丰城 331100;厦门海关技术中心,福建 厦门 361000
文献出处:
引用格式:
[1]吴欢生;王飞兵;杨艳;周光斌;陈晨;徐田放;周贝怡;陈依婷;薛美佳;曹华斌-.野猪源猪圆环病毒4型的发现及其Cap基因序列分析)[J].中国预防兽医学报,2022(10):1106-1110
A类:
JXNC,JXYC,JXGZ,E115Cap,E115,PCV4Cap
B类:
野猪,猪源,猪圆环病毒,基因序列分析,家猪,多系统,呼吸道疾病,皮炎,肾病综合征,在野,进化特征,淋巴结,脾脏,探针法,TaqMan,qPCR,样品检测,进化关系,扩增结果,扩增到,bp,条带,序列比对,比对分析,全长,同源性分析,氨基酸序列,国野,内家,序列同源性,别存,变数,系统发育分析,同属,亲缘关系,宿主,基因组特征,遗传进化分析
AB值:
0.188661
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