典型文献
2019-2021年江苏地区PCV3感染情况调查及其Cap基因的遗传演化分析
文献摘要:
为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在江苏地区规模化猪场的感染及病毒演化情况,对2019-2021年收集的113份临床组织样品进行Cap基因的检测,应用DNAStar和MEGA软件对获得的序列进行遗传演化分析.结果显示:PCV3样品阳性率为37.17%(42/113),猪场阳性率为73.91%(17/23).对29个阳性样品的PCR产物直接测序,显示核苷酸序列高度同源,同源性为97.3%~100.0%.挑取其中的12个阳性样品,扩增Cap全长序列,连接至pMD19-T平末端载体后测序,显示12条序列的核苷酸同源性为97.5%~99.8%,与国内外其他PCV3毒株Cap基因的同源性为97.0%~100%.遗传演化分析显示,3条序列与国内外PCV3亚群3a的毒株处于一个大的分支,6条序列属于3b,3条序列形成独立的分支(3c).推导编码氨基酸后对24和27位氨基酸位点进行分析,1条序列为A24K27,2条序列为A24R27,9条序列为V24K27.本试验丰富了江苏地区PCV3感染的分子流行病学数据,为该地区PCV3感染的综合防控提供了科学依据.
文献关键词:
猪圆环病毒3型;Cap;遗传演化;变异
中图分类号:
作者姓名:
王小泉;刘晓东;董友富;唐伟明;李豪;孙刘妹;张振东
作者机构:
江苏科技大学生物技术学院,江苏镇江 212018;动物基因工程疫苗国家重点实验室,山东青岛 266000
文献出处:
引用格式:
[1]王小泉;刘晓东;董友富;唐伟明;李豪;孙刘妹;张振东-.2019-2021年江苏地区PCV3感染情况调查及其Cap基因的遗传演化分析)[J].畜牧与兽医,2022(10):111-115
A类:
A24K27,A24R27,V24K27
B类:
江苏地区,PCV3,感染情况调查,Cap,遗传演化分析,猪圆环病毒,规模化猪场,演化情况,DNAStar,MEGA,样品阳性率,直接测序,同源性,全长,pMD19,后测,毒株,亚群,3a,3b,3c,氨基酸位点,分子流行病学,综合防控
AB值:
0.259965
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