典型文献
安徽省境外输入新冠病毒Delta变异株的首次发现与鉴定
文献摘要:
为鉴定此次安徽省境外输入新型冠状病毒的分子特征,本研究对两例病例进行了高通量测序和基因组序列分析.高通量测序获得两株病毒的基因组全长分别为29 858nt和29 858nt,利用NextStrain和2019新型冠状病毒信息库()在线分析对两例毒株全基因组核苷酸和氨基酸变异位点进行分析.将全基因组序列上传到()和()网站,通过在线网站分析结果显示,两株病毒均为B.1.617.2变异株(Delta),NextStrain进化分析为21A.两株毒株分别发现了 49和48个核苷酸突变位点,氨基酸的变异位点分别有35和34个,其中存在相同的7个同义突变.两株病毒主要在ORF7a基因上C27527T(P45L)的突变不同.这是安徽省首次发现境外输入的B.1.617.2变异株(Delta株)此变异株存在引发本地的流行和爆发的风险,需要严密持续的对境外输入病例进行流行病学调查和病毒基因分子特征分析.
文献关键词:
新型冠状病毒;B.1.617.2变异株;境外输入;全基因组测序
中图分类号:
作者姓名:
王鹏;栗薇薇;侯赛;陈晓龙;吴小珉;马泰;田佳明;袁媛;俞俊岭;罗婉蓉;葛盈露;陈晴晴;周雪;何军;苏斌
作者机构:
安徽省疾病预防控制中心,合肥230601;宣城市疾病预防控制中心,宣城242000
文献出处:
引用格式:
[1]王鹏;栗薇薇;侯赛;陈晓龙;吴小珉;马泰;田佳明;袁媛;俞俊岭;罗婉蓉;葛盈露;陈晴晴;周雪;何军;苏斌-.安徽省境外输入新冠病毒Delta变异株的首次发现与鉴定)[J].病毒学报,2022(05):1135-1141
A类:
858nt,NextStrain,ORF7a,C27527T,P45L
B类:
新冠病毒,Delta,变异株,分子特征,两例,基因组序列分析,两株,基因组全长,病毒信息,信息库,在线分析,毒株,氨基酸变异,变异位点,全基因组序列,列上,传到,线网,进化分析,21A,核苷酸突变,突变位点,同义突变,境外输入病例,流行病学调查,病毒基因,全基因组测序
AB值:
0.23904
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