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基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义
文献摘要：
目的 探讨BUB1在卵巢癌(Ovarian cancer,OV)中的表达及与预后的关系.方法 利用Oncomine数据库挖掘BUB1在各种肿瘤中的表达;通过GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier数据库分析BUB1在卵巢癌中的预后价值;通过Coexpedia数据库构建BUB1在卵巢癌中的共表达基因网络,并用FunRich软件对score>13的共表达基因注释.利用WebGestalt对其进行KEGG通路富集分析.按score高低筛选出关键基因,GEPIA进一步分析BUB1与关键基因的相关性.结果(1)从Oncomine数据库检索出BUB1基因相关研究424项,其中高表达85项,低表达15项.(2)GE-PIA分析表明,BUB1在卵巢癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05).(3)Kaplan-Meier数据库分析结果显示,BUB1基因低表达的卵巢癌患者总生存期(HR=1.2,P<0.05)增加.(4)BUB1的共表达基因主要有AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2、BUB1B、DEPDC1、KIF23、CDCA3、TTK、ASPM、BIRC5、HJURP、PRC1、CENPF、TOP2A、KIF20A、CCNB2、PTTG1和CCNB1.(5)其生物学功能主要涉及信号传导等;KEGG分析主要参与细胞周期等进程.(6)按score高低排序,筛选出4个关键基因,分别为AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2.BUB1与AURKA(R=0.77)、DLGAP5(R=0.84)、KIF2C(R=0.81)和TPX2(R=0.76)的表达呈显著正相关.结论 在卵巢癌组织中BUB1呈高表达,且与患者预后呈负相关.
文献关键词：
卵巢癌;BUB1;GEPIA;Oncomine
中图分类号：
作者姓名：
马玉博;张乃文;潘博;刘晓雪;任凤云
作者机构：
牡丹江医学院;牡丹江医学院附属红旗医院影像科,黑龙江 牡丹江 157011
文献出处：
引用格式：
[1]马玉博;张乃文;潘博;刘晓雪;任凤云-.基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义)[J].牡丹江医学院学报,2022(01):35-38,15
A类：
DEPDC1
B类：
挖掘分析,Ovarian,cancer,OV,Oncomine,GEPIA,数据库分析,卵巢癌组织,Kaplan,Meier,预后价值,Coexpedia,数据库构建,共表达基因,FunRich,score,基因注释,WebGestalt,通路富集分析,关键基因,数据库检索,低表达,正常组织,卵巢癌患者,总生存期,AURKA,DLGAP5,KIF2C,TPX2,BUB1B,KIF23,CDCA3,TTK,ASPM,BIRC5,HJURP,PRC1,CENPF,TOP2A,KIF20A,CCNB2,PTTG1,CCNB1,生物学功能,信号传导,细胞周期
AB值：
0.365607
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