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典型文献
肺腺癌关键基因的鉴别及预后
文献摘要:
目的 利用生物信息学方法对肺腺癌基因表达谱进行研究,筛选出该病发生相关的关键基因.方法 通过对GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中肺腺癌患者基因芯片数据的检索获取基因表达数据,利用美国国立卫生研究院提供的GEO2R基因差异表达在线分析工具进行数据分析,然后对差异基因进行GO和KEGG富集分析,利于STRING数据库构建蛋白互作网络,将蛋白互作数据导入到Cytoscape软件,然后基于MCC算法选取排名前十的基因,也就是关键基因,对关键基因进行生存分析确定其预后价值.结果 共得到出855个差异基因,其中558个为下调基因,297个为上调基因.MCC算法所选取的关键基因分别是CCNB1、BUB1B、AURKA、BIRC5、TPX2、PRC1、BUB1、MAD2L1、CENPF和CDKN3,生存分析表明这些关键基因高表达的患者其生存时间显著减少.结论 利用生物信息学方法可以有效选取肺腺癌发病的关键基因,这些基因的高表达与患者生存时间明显相关,这些关键基因的发现将为肺腺癌治疗药物的开发提供新的重要分子靶标.
文献关键词:
肺腺癌;关键基因;基因表达谱
作者姓名:
黄河;李成长;彭燕;姜洪波
作者机构:
新乡市中心医院(新乡医学院第四临床学院)呼吸与危重症医学科一,河南 新乡 453000;新乡医学院基础医学院生理学与病理生理学系;新乡医学院第三附属医院营养科
文献出处:
引用格式:
[1]黄河;李成长;彭燕;姜洪波-.肺腺癌关键基因的鉴别及预后)[J].中国老年学杂志,2022(01):33-37
A类:
B类:
关键基因,利用生物,生物信息学方法,癌基因,基因表达谱,Gene,Expression,Omnibus,肺腺癌患者,基因芯片,基因表达数据,美国国立卫生研究院,GEO2R,基因差异表达,在线分析工具,差异基因,富集分析,STRING,数据库构建,蛋白互作网络,作数,数据导入,导入到,Cytoscape,MCC,生存分析,预后价值,CCNB1,BUB1B,AURKA,BIRC5,TPX2,PRC1,MAD2L1,CENPF,CDKN3,生存时间,治疗药物,分子靶标
AB值:
0.42041
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