典型文献
多数据库研究CRYAB在宫颈癌中的表达及相关机制
文献摘要:
目的 利用生物信息学研究αB-晶状体蛋白(CRYAB)在宫颈癌(CC)中的表达情况及其相关机制.方法 分别通过UALCAN、临床生信之家和仙桃学术分析CRYAB在宫颈癌及泛癌中的表达;通过GEPIA数据库分析CRYAB与宫颈癌患者生存期的关系;应用UALCAN数据库分析CRYAB与宫颈癌患者临床病理特征的关系;通过TIMER 2.0数据库分析在宫颈癌组织中CRYAB表达量与免疫细胞浸润的相关性;通过LinkedOmics数据库查找CRYAB共表达基因,利用STRING数据库查找关键基因,应用Metascape网站进行GO注释和KEGG通路分析.结果 CRYAB在宫颈癌组织中低表达;CRYAB的表达与宫颈癌患者生存期无相关性;其表达量与患者肿瘤分期、人种、体重、年龄、组织学类型和淋巴转移相关;它能诱导机体多种免疫细胞参与肿瘤调控.共表达基因分析显示,按P值升序排列与CRYAB正相关的基因是NDRG4、IVL、KRT75、SBSN和FABP12;负相关的基因是KIAA0649、TMPRSS3、GOLM1、ALDH3B1和RHOBTB2.GO注释显示共表达基因参与表皮发育、包膜角化、多肽交叉连接、钙离子结合和中间纤维细胞骨架组织等,KEGG通路富集在金黄色葡萄球菌感染、粘蛋白O-聚糖生物合成、核苷酸糖的生物合成、IL-17信号通路和癌症的通路等.结论 CRYAB在宫颈癌中低表达,与宫颈癌的发生发展存在一定的关系,有望成为宫颈癌的生物标志物和潜在的治疗靶点.
文献关键词:
数据库;生物信息学;αB-晶状体蛋白;宫颈肿瘤
中图分类号:
作者姓名:
黄宏宝;吴小勤;卢东林;覃莉;韦敬锡;罗小琼;黄秋艳;陈发钦
作者机构:
右江民族医学院,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院生殖医学中心,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院临床病理诊断与研究中心,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院妇科,广西 百色 533000
文献出处:
引用格式:
[1]黄宏宝;吴小勤;卢东林;覃莉;韦敬锡;罗小琼;黄秋艳;陈发钦-.多数据库研究CRYAB在宫颈癌中的表达及相关机制)[J].右江民族医学院学报,2022(03):382-388
A类:
KRT75,SBSN,FABP12,KIAA0649,TMPRSS3,ALDH3B1
B类:
数据库研究,CRYAB,相关机制,利用生物,生物信息学研究,晶状体蛋白,CC,UALCAN,生信,之家,仙桃,泛癌,GEPIA,数据库分析,宫颈癌患者,生存期,临床病理特征,TIMER,宫颈癌组织,免疫细胞浸润,LinkedOmics,共表达基因,STRING,关键基因,Metascape,通路分析,低表达,无相,肿瘤分期,人种,组织学类型,淋巴转移,移相,肿瘤调控,基因分析,升序,NDRG4,IVL,GOLM1,RHOBTB2,包膜,角化,多肽,钙离子,离子结合,纤维细胞,细胞骨架,通路富集,金黄色葡萄球菌感染,粘蛋白,生物合成,生物标志物,治疗靶点,宫颈肿瘤
AB值:
0.323774
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