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典型文献
基于生物信息学分析艾滋病患者血中相关差异基因
文献摘要:
目的 基于生物信息学方法筛选艾滋病(AIDS)相关的关键基因,为后续生物学功能研究提供分子靶标.方法 通过GEO数据库下载基因芯片GSE140713,筛选AIDS患者血样与健康对照血样的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并且通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),确定其中与AIDS发生发展密切相关的关键基因.结果 GEO数据分析结果显示,AIDS共有1770个DEGs(1128个上调基因,642个下调基因).GO富集分析结果显示,DEGs主要参与DNA结合转录激活活性、信号受体激活物活性等分子功能.KEGG通路富集分析结果显示,DEGs主要富集于NOD样受体信号通路.经过构建PPI网络分析其重要的功能模块及其关键基因,结果鉴定出5个关键基因可能与AIDS的发生发展相关.结论 本研究筛选出人AIDS血液中5个关键基因(CDK1、BUB1、CCNA2、CCNB1、KIF11),它们可能成为AIDS病毒潜伏期治疗的潜在靶点.
文献关键词:
AIDS;差异表达基因;关键基因;潜在靶点
作者姓名:
张琳萄;崔道林
作者机构:
655000 云南曲靖,曲靖医学高等专科学校机能与形态研究所
引用格式:
[1]张琳萄;崔道林-.基于生物信息学分析艾滋病患者血中相关差异基因)[J].齐齐哈尔医学院学报,2022(19):1815-1820
A类:
GSE140713
B类:
生物信息学分析,艾滋病患者,差异基因,生物信息学方法,AIDS,关键基因,生物学功能,功能研究,分子靶标,GEO,下载,基因芯片,血样,差异表达基因,DEGs,功能富集分析,通路富集分析,String,数据库构建,蛋白质相互作用网络,PPI,转录激活活性,激活物,NOD,样受体,功能模块,CDK1,BUB1,CCNA2,CCNB1,KIF11,潜伏期,潜在靶点
AB值:
0.312567
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