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基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法研究
文献摘要：
目的 提出一种基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法,并与现有的用于常染色体的GEMMA方法进行比较.方法 对不同的X染色体失活程度 γ 分别建立线性混合模型,构造Wald检验统计量,并对相应的P值使用柯西分布进行合并,将该方法记为XACAT.在不同的失活模式设置下,模拟比较XACAT方法与GEM-MA方法的第一类错误率和检验效能,并将它们运用到行为抑制解除全基因组家系数据做进一步比较.结果 两种方法均能很好地控制第一类错误率.当γ等于1(随机失活)时,两种方法的检验效能很接近.当γ不等于1(偏倚失活)时,XACAT方法比GEMMA方法的检验效能高,且γ偏离1越远,XACAT方法的优势越明显.实例分析中,XACAT方法识别出两个有统计学意义的位点(rs12687163与rs12688347),GEMMA法未识别出有统计学意义的位点.结论 XACAT方法是一种检验效能较高、稳健的关联分析方法.
文献关键词：
X;染色体失活;关联分析;家系数据;数量性状;柯西分布
中图分类号：
作者姓名：
孔艺凡;李锦;周基元
作者机构：
南方医科大学公共卫生学院生物统计学系 510515
文献出处：
引用格式：
[1]孔艺凡;李锦;周基元-.基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法研究)[J].中国卫生统计,2022(05):659-662,668
A类：
家系数据,XACAT,rs12687163,rs12688347
B类：
数据合并,染色体失活,数量性状,性状关联,常染色体,GEMMA,线性混合模型,Wald,检验统计量,柯西分布,行合并,记为,第一类错误,错误率,检验效能,行为抑制,全基因组,随机失活,偏倚,越远,方法识别
AB值：
0.227316
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