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典型文献
基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
文献摘要:
目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据.方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证.结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个.富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路.外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673.结论 补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据.
文献关键词:
小麦不耐受;差异表达蛋白;变量筛选
作者姓名:
赵敏;张薇;孙琳;王玉鹏;刘美娜
作者机构:
哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081
文献出处:
引用格式:
[1]赵敏;张薇;孙琳;王玉鹏;刘美娜-.基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究)[J].中国卫生统计,2022(03):329-334
A类:
sigFeature,小麦不耐受,ITIH2
B类:
差异蛋白筛选,蛋白质组学技术,变量筛选,筛选方法,血清差异表达蛋白,富集分析,血清样本,TMT,定量蛋白质组学,技术获得,功能注释,外部数据,技术鉴定,白参,脱颗粒,急性期反应,生物学过程,联通,外部验证,补体系统,脂质代谢,代谢过程,关键蛋白,人体血清,血清蛋白质组学,调控机制
AB值:
0.200225
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