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基于生物信息学分析构建转录因子E2F1调控微RNA及其靶向基因网络
文献摘要：
目的 运用生物信息学方法分析构建E2F1对微RNA(miRNA)的转录调控进而影响下游靶基因mRNA的转录因子网络,从而探讨E2F1通过miRNA参与肿瘤发生发展的机制.方法 基于TCGA数据库筛选存在E2F1上调表达的肿瘤组,检索存在E2F1差异表达的20种肿瘤组织中差异表达的miRNAs.分析差异表达miRNAs的靶基因,并与差异表达mRNAs取交集以构建E2F1-miRNA-mRNA调控网络,对靶基因进行富集分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建蛋白质相互作用网络,讨论E2F1调控miRNA及其靶基因,进而影响肿瘤发生发展的生物机制.结果 通过生物信息学方法分析构建的TF-miRNA-mRNA调控网络,展现了miR-7,miR-9,miR-17,miR-21,miR-22,miR-24并调节micoRNA in cancer信号通路.结论 E2F1转录因子在多种癌症中起促癌作用,本研究为泛基因组癌症的早诊与设计治疗药物提供了潜在的靶点.
文献关键词：
泛基因组;E2F1;miRNA;mRNA;调控网络
中图分类号：
作者姓名：
朱文韬;曲浩宁;何群
作者机构：
中国医科大学生命科学学院生物信息教研室,沈阳 110122
文献出处：
引用格式：
[1]朱文韬;曲浩宁;何群-.基于生物信息学分析构建转录因子E2F1调控微RNA及其靶向基因网络)[J].中国医科大学学报,2022(03):231-237
A类：
B类：
生物信息学分析,E2F1,生物信息学方法,转录调控,靶基因,子网络,肿瘤发生发展,TCGA,差异表达,肿瘤组织,miRNAs,mRNAs,交集,调控网络,对靶,富集分析,京都基因与基因组百科全书,蛋白质相互作用网络,TF,micoRNA,cancer,促癌作用,泛基因组,早诊,治疗药物
AB值：
0.255781
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