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宽体金线蛭WpE基因的克隆及生物信息学分析
文献摘要：
目的:克隆宽体金线蛭(WpE)基因,并进行生物信息学分析,为进一步研究宽体金线蛭药用价值提供理论基础.方法:从宽体金线蛭唾液腺转录组数据库筛选到WpE基因转录本,通过PCR反应验证WpE基因cDNA全长序列,运用生物信息学分析WpE基因碱基序列性质及其对应氨基酸序列的特性.结果:宽体金线蛭WpE基因碱基序列全长258 bp,编码85个氨基酸,其中包含一个由16个氨基酸组成的信号肽,成熟蛋白理论相对分子质量为8.093 kDa,理论等电点(PI)为5.85,该蛋白为亲水性蛋白,属于马铃薯抑制剂Ⅰ家族.结论:成功克隆出宽体金线蛭WpE基因,分析其序列的结构特征,该基因编码的蛋白质含有马铃薯抑制剂Ⅰ家族保守活性位点Asp46,其结合环能与胰凝乳蛋白酶结合并使其失活,具有抗炎与抗凝活性.
文献关键词：
宽体金线蛭;WpE基因;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
程搏幸;卢昱希;匡诗涛;吴正关;田青青;邵贵燕;刘飞
作者机构：
贵州师范学院生物科学学院,贵州贵阳 550018;贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州贵阳 550002;盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城 224051
文献出处：
引用格式：
[1]程搏幸;卢昱希;匡诗涛;吴正关;田青青;邵贵燕;刘飞-.宽体金线蛭WpE基因的克隆及生物信息学分析)[J].贵州师范学院学报,2022(06):1-7
A类：
WpE,Asp46
B类：
宽体金线蛭,生物信息学分析,药用价值,从宽,唾液腺,转录组数据,基因转录,转录本,应验,cDNA,全长,碱基序列,序列性,氨基酸序列,bp,氨基酸组成,信号肽,相对分子质量,kDa,等电点,亲水性,马铃薯,基因编码,活性位点,合环,凝乳蛋白酶,失活,抗凝活性,基因克隆
AB值：
0.237222
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