典型文献
基于生物信息学分析骨质疏松症与炎症性肠病的相关性
文献摘要：
目的 通过生物信息学策略探讨骨质疏松症(OP)与炎症性肠病(IBD)间的基因相关性.方法 分别以"osteoporosis"及"Inflammatory bowel disease"为关键词从网络疾病数据库(DisGeNET、TTD、OMIM、GeneCards)中遴选相关基因,去重后将两组靶基因进行映射得到交集靶点并使用R软件进行GO功能及KEGG通路富集分析,通过string网站分析得到蛋白相互作用网络图,通过cytoHubba插件中的MCC算法筛选出关键靶点,借助网络分析工具Networkanalyst预测关联miRNA并绘制网络图.结果 获得OP和IBD相关靶点分别为1779和2779个,获得交集靶点869个,R软件富集得到4278项GO功能富集结果及173条KEGG信号通路,共筛选到10个关键靶点.结论 IL6、IL10、IL17A、TNF、CSF2、IL4、IL1B、CXCL8、IFNG、IL13作用的炎症通路的激活可能是OP与IBD的共同病因,miR-98-5p、miR-335-5p、miR-24-3p和miR-106a-5p可能作为治疗IBD和OP的新手段.
文献关键词：
骨质疏松症;炎症性肠病;白细胞介素6;白细胞介素10;肿瘤坏死因子类;非编码单链RNA
中图分类号：
作者姓名：
常裕绅;张子鸣;李振宇;安娟;何瀚威;匡建军
作者机构：
410208 长沙,湖南中医药大学研究生院;410006 长沙,湖南省中医药研究院
文献出处：
引用格式：
[1]常裕绅;张子鸣;李振宇;安娟;何瀚威;匡建军-.基于生物信息学分析骨质疏松症与炎症性肠病的相关性)[J].解放军医药杂志,2022(09):50-54
A类：
Networkanalyst,IL17A,IL13,肿瘤坏死因子类
B类：
生物信息学分析,骨质疏松症,炎症性肠病,策略探讨,OP,IBD,osteoporosis,Inflammatory,bowel,disease,DisGeNET,TTD,OMIM,GeneCards,选相,靶基因,交集靶点,通路富集分析,string,蛋白相互作用网络,网络图,cytoHubba,插件,MCC,关键靶点,miRNA,功能富集,集结,IL6,IL10,CSF2,IL4,IL1B,CXCL8,IFNG,炎症通路,5p,3p,106a,新手,非编码,单链
AB值：
0.388066
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