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典型文献
基于网络药理学的柴胡治疗癫痫有效活性成分、作用靶基因筛选及靶基因生物学功能分析
文献摘要:
目的 基于网络药理学筛选柴胡治疗癫痫的有效活性成分、作用靶基因,并分析其靶基因生物学功能.方法 通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库,筛选出柴胡的有效活性成分及其相关靶基因.利用GeneCards、TTD、DisGeNET、OMIM数据库检索出癫痫相关靶基因.利用Draw Venn Diagram在线工具将柴胡的有效活性成分靶基因与癫痫相关靶基因取交集,得到柴胡-癫痫的共同靶基因.利用R软件对柴胡-癫痫共同靶基因进行GO分子功能和KEGG信号通路富集分析.通过STRING数据库构建柴胡-癫痫共同靶基因的PPI网络图,根据度值筛选核心基因.根据柴胡-癫痫共同靶基因的"活性成分-靶点-通路"及PPI网络中的共同核心靶基因,选取受体、配体,利用Autodock4软件进行分子对接,验证柴胡-癫痫共同核心靶基因与柴胡有效活性成分的结合活性.结果 得到柴胡有效活性成分14个及其靶基因273个,癫痫相关靶基因2020个,取交后集得到柴胡-癫痫共同靶基因77个.构建的柴胡-癫痫的"药物-活性成分-疾病-靶点"网络显示,柴胡通过槲皮素、豆甾醇、山奈酚等13种有效活性成分作用于ESR1、VEGFA等77个共同靶基因.柴胡-癫痫共同靶基因的GO分子功能主要涉及神经递质受体活性、细胞因子活性等,KEGG信号通路主要富集在IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等.TP53、IL-1B、CXCL8、TNF等靶基因与豆甾醇、3,5,6,7-四甲氧基-2-(3,4,5-三甲氧基苯基)色酮等柴胡有效活性成分具有良好亲和力.结论 槲皮素、豆甾醇、山奈酚等13种柴胡有效活性成分作用于ESR1、VEGFA等77个柴胡-癫痫共同靶基因,通过调节神经递质、抗炎、抗氧化应激等途径发挥治疗癫痫的作用.
文献关键词:
柴胡;癫痫;网络药理学;分子对接技术
作者姓名:
李欣;陈嘉诚;乔月朋;马爱华
作者机构:
山东第一医科大学附属省立医院小儿神经科,济南250021;梁山县人民医院儿科
文献出处:
引用格式:
[1]李欣;陈嘉诚;乔月朋;马爱华-.基于网络药理学的柴胡治疗癫痫有效活性成分、作用靶基因筛选及靶基因生物学功能分析)[J].山东医药,2022(09):57-62
A类:
B类:
网络药理学,柴胡,癫痫,活性成分,靶基因,基因筛选,生物学功能分析,系统药理学,技术平台,TCMSP,SwissTargetPrediction,GeneCards,TTD,DisGeNET,OMIM,数据库检索,Draw,Venn,Diagram,交集,信号通路富集,通路富集分析,STRING,数据库构建,PPI,网络图,核心基因,Autodock4,结合活性,槲皮素,豆甾醇,山奈酚,成分作用,ESR1,VEGFA,神经递质,肿瘤坏死因子信号通路,TP53,1B,CXCL8,甲氧基,苯基,色酮,亲和力,抗氧化应激,分子对接技术
AB值:
0.282047
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