典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探讨麻杏石甘汤加减方治疗新型冠状病毒肺炎的机制
文献摘要：
目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨麻杏石甘汤加减方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的机制.方法 首先在TCMSP数据库中查找、筛选麻杏石甘汤加减方基本中药组成的有效化学成分及靶点,并利用Uniptro数据库将靶点转换为相应基因名称.利用GeneCard、TTD、DrugBank数据库确定COVID-19疾病靶点基因,取二者的交集得到共有基因.在String数据库中检索上述共有基因,获得靶基因的蛋白质互作网络(PPI).使用Cytoscape3.8软件将结果可视化,再利用其中的CytoNCA插件计算核心网络.通过R软件clusterProfiler软件包对靶基因进行基因本体及京都基因与基因组百科全书富集分析,然后通过PubChem数据库下载药物有效成分的二维结构,使用ChemBio3D软件生成其3D结构.PDB数据库下载蛋白受体得到3D结构文件.最后使用vina软件进行分子对接.结果 麻杏石甘汤加减方活性成分240种,靶点基因329个,疾病靶点393个,共同靶点22个,PPI有139条边,22个节点.白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子均为连接度最高的节点.主要富集在Toll-like受体信号通路、T淋巴细胞受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用等与炎症及免疫相关的通路.药物成分可与IL-6稳定结合.结论 麻杏石甘汤加减方通过多成分、多靶点、多途径作用于COVID-19,为COVID-19的中药治疗提供了理论基础.
文献关键词：
麻杏甘汤加减方;新型冠状病毒肺炎;白细胞介素-6;网络药理学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
刘启平;周俊豪;张宁;韩鹏凯
作者机构：
重庆大学附属三峡医院 呼吸与危重症医学科 404000;重庆大学附属三峡医院 全科医学江南病区 404000
文献出处：
引用格式：
[1]刘启平;周俊豪;张宁;韩鹏凯-.基于网络药理学和分子对接技术探讨麻杏石甘汤加减方治疗新型冠状病毒肺炎的机制)[J].重庆医学,2022(23):4065-4071
A类：
Uniptro,ChemBio3D,麻杏甘汤加减方
B类：
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,麻杏石甘汤加减,TCMSP,药组,有效化学成分,GeneCard,TTD,DrugBank,靶点基因,交集,String,靶基因,蛋白质互作网络,PPI,Cytoscape3,CytoNCA,插件,核心网络,clusterProfiler,软件包,对靶,基因本体,京都基因与基因组百科全书富集分析,PubChem,下载,载药,药物有效成分,二维结构,PDB,vina,活性成分,连接度,Toll,like,细胞受体,自然杀伤细胞,细胞毒作用,免疫相关,药物成分,多成分,多靶点,多途径,中药治疗
AB值：
0.252856
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