典型文献
hsa-miR-92a-3p靶基因预测及生物信息学分析
文献摘要：
目的:探究hsa-miR-92a-3p在不同人类疾病中的表达差异,利用多种生物信息数据库对hsa-miR-92a-3p的靶基因及对靶基因的生物学功能进行预测分析,构建靶基因集合编码蛋白质间的相互关系网络.方法:通过使用miRDB、TargetScan、Clip-seq、miRWalk四个数据库预测hsa-miR-92a-3p的靶向调控基因,利用venny2.0取交集,最终确定hsa-miR-92a-3p的靶基因集合范围.然后通过string11.5构建所预测靶基因集合编码蛋白质间的相互关系网络图.最后通过DAVID和KOBAS3.0公共数据库对所预测的靶基因交集进行功能富集分析(GO分析)和信号转导通路富集分析(KEGG分析).结果:筛选出192个hsa-miR-92a-3p的靶基因,PTEN、ITPR1、MAPK8、FBXW7、KAT2B、SMAD7为关键靶基因,通过GO分析及KEGG分析,发现这些靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、细胞衰老等信号通路中.结论:初步探索了hsa-miR-92a-3p靶基因调控网络,为进一步深入研究hsa-miR-92a-3p的分子调控机制及成为临床诊断和检测潜在的生物标志物提供理论依据.
文献关键词：
hsa-miR-92a-3p;生物信息学;靶基因;miRNA;肿瘤
中图分类号：
作者姓名：
翁雪婷;陈莹;林双;廖温靖;黄婕;蔡艺煌
作者机构：
厦门医学院,福建 厦门 361023;口腔生物材料福建省高校工程研究中心,福建 厦门 361023
文献出处：
引用格式：
[1]翁雪婷;陈莹;林双;廖温靖;黄婕;蔡艺煌-.hsa-miR-92a-3p靶基因预测及生物信息学分析)[J].吉林医学,2022(11):2894-2898
A类：
string11,KOBAS3,KAT2B
B类：
hsa,92a,3p,靶基因预测,生物信息学分析,人类疾病,表达差异,生物信息数据库,对靶,生物学功能,预测分析,合编,编码蛋白,关系网络,miRDB,TargetScan,Clip,seq,miRWalk,靶向调控,调控基因,venny2,交集,建所,网络图,DAVID,公共数据库,功能富集分析,信号转导通路,通路富集分析,PTEN,ITPR1,MAPK8,FBXW7,SMAD7,关键靶基因,PI3K,Akt,FoxO,细胞衰老,初步探索,基因调控网络,分子调控机制,生物标志物,miRNA
AB值：
0.340575
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