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溃疡性结肠炎患者对英夫利昔单抗原发性失应答的肠道黏膜基因筛选
文献摘要：
目的 筛选英夫利西单抗(IFX)治疗溃疡性结肠炎(UC)的原发性失应答与应答患者的差异表达基因(DEGs)并进行生物信息学分析,预测对IFX失应答的UC患者的潜在靶点.方法 采用GEO2R在线工具软件分析IFX治疗的UC患者数据集GSE14580、GES 12251和GSE23597,获得DEGs;通过String数据库构建DEGs-蛋白质相互作用(PPI)网络,应用David软件进行功能和信号途径富集分析;通过Cytoscape软件及cytoHubba插件筛选出关键基因,导入DGIdb数据库中寻找潜在有效的生物制剂.结果 共筛选出UC患者对IFX治疗原发性失应答的DEGs 143个,其中上调基因10个、下调基因133个;基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析提示,DEGs主要富集于炎症反应、免疫反应、对维生素D反应、Toll样受体(TLR)通路以及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等.将Cytoscape软件及cytoHubba插件筛选出的得分最高的前20个关键基因导入DGIdb数据库进行分析,得分排名前3位的潜在有效的生物制剂分别为萨利鲁单抗、阿伐可泮、托拉利单抗.结论 UC原发性失应答样本中共有143个DEGs,主要富集于白细胞介素-6产生的调控、对维生素D的反应、TLR通路以及TNF信号通路等.萨利鲁单抗、阿伐可泮、托拉利单抗是对IFX治疗原发性失应答的UC患者潜在的治疗药物.
文献关键词：
溃疡性结肠炎;差异基因;生物信息学;英夫利昔单抗;失应答
中图分类号：
作者姓名：
杨想;吴莺
作者机构：
江苏大学附属医院消化内科,江苏镇江,212000
文献出处：
引用格式：
[1]杨想;吴莺-.溃疡性结肠炎患者对英夫利昔单抗原发性失应答的肠道黏膜基因筛选)[J].实用临床医药杂志,2022(02):98-103,118
A类：
GSE14580,GSE23597
B类：
溃疡性结肠炎患者,英夫利昔单抗,失应答,肠道黏膜,基因筛选,英夫利西单抗,IFX,UC,差异表达基因,DEGs,生物信息学分析,潜在靶点,GEO2R,工具软件,患者数据,GES,String,数据库构建,蛋白质相互作用,PPI,David,信号途径,富集分析,Cytoscape,cytoHubba,插件,关键基因,DGIdb,生物制剂,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,免疫反应,Toll,样受体,TLR,分排,托拉,治疗药物,差异基因
AB值：
0.243394
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