典型文献
肺腺癌中CDK1的生物信息学分析
文献摘要：
目的:分析基于生物信息学对CDK1在肺腺癌(LUAD)中的表达和临床意义.方法:通过GEPIA分析CDK1的表达,在UALCAN数据库中分析肺腺癌分期、淋巴结转移等临床特征与CDK1表达的关系,GEPIA分析CDK1表达与肺腺癌预后的关系,Oncomine数据库挖掘CDK1的共表达基因,WebGestalt对共表达基因进行G0和KEGG通路富集分析.String数据库整合基因蛋白互作网络(PPI),并进行Cytoscape可视化分析,CytoHubba挑选核心基因.Kaplan-Meier plotter和GEPIA数据库对筛选出的hub基因进行了更多的分析和验证.结果:在肺腺癌中,CDK1表达明显高出正常组织(P<0.01).UALCAN数据库分析表明肺腺癌患者的分期、性别等临床特征与CDK1的表达没有显著相关性.GEPIA分析显示,与CDK1高表达的肺腺癌患者相比,CDK1低表达患者的总生存率增加(P<0.05).Oncomine数据库筛选出CDK1的共表达基因有TOP2A、MCM4等18个基因.GO分析显示,CDK1共表达基因主要与染色体定位、染色体凝集、ATP酶活性相关KEGG分析显示,CDK1共表达基因参与p53信号通路等进程.借助String、Cytoscape、CytoHubba,获得CDK1共表达基因的PPI网络,继而挑选hub基因,按Degree大小排列顺序选择5个hub基因,分别是CDC6、MAD2L1、TOP2A、KIAA0101、MCM4.最后,证实5个hub基因和肺腺癌患者的预后密切相关.结论:在肺腺癌患者中CDK1高表达,且与肺腺癌患者的预后息息相关,为肺腺癌的治疗及诊断提供重要指导.
文献关键词：
生物信息学;CDK1;肺腺癌;GEPIA
中图分类号：
作者姓名：
马玉博;潘博;赵若晗;任凤云
作者机构：
牡丹江医学院,黑龙江 牡丹江 157011;牡丹江医学院附属红旗医院影像科
文献出处：
引用格式：
[1]马玉博;潘博;赵若晗;任凤云-.肺腺癌中CDK1的生物信息学分析)[J].包头医学院学报,2022(07):33-38,76
A类：
数据库整合,KIAA0101
B类：
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AB值：
0.250108
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