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典型文献
基于数据挖掘AGR2在胰腺癌中的表达及预后潜力
文献摘要:
目的 探究前梯度蛋白2(AGR2)和非肿瘤胰腺组织与胰腺癌之间的关系,汇总AGR2在胰腺癌组织的表达情况,为后续的肿瘤风险评估和治疗提供有力的依据.方法 利用GEO数据库分析AGR2基因表达及染色体定位,利用Oncomine数据库分析AGR2 mRNA在胰腺癌芯片中的表达状态,基于GEPIA2数据库挖掘出AGR2与胰腺癌病理分期及预后的关系,借助String数据库分析AGR2在癌症基因表达的关键靶蛋白,借助GeneMANIA分析AGR2基因在胰腺癌发展过程中可能的调控通路,通过UALCAN数据库在多种样本综合分析条件下评估AGR2甲基化对胰腺癌患者生存预后的影响.结果 AGR2基因在胰腺癌癌组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同病理分期胰腺癌患者AGR2基因表达比较,差异有统计学意义(P<0.05);AGR2共表达基因分析显示,S100P、CDC25B、C-K-RAS、HER3等基因与AGR2基因表达呈正相关;AGR2基因主要负责蛋白质泛素化的正向调控、Wnt通路的调控以及共表达蛋白组靶向.结论 AGR2在胰腺癌组织中呈高表达,其表达水平与胰腺癌的预后有关,有望成为胰腺癌预后评估和治疗的有效靶点.
文献关键词:
胰腺癌;前梯度蛋白;差异表达基因;共表达蛋白组
作者姓名:
王雨娜;吴冬桂;赵贝
作者机构:
大理大学基础医学院,云南 大理 671000;珠海市人民医院外科,广东 珠海 519000
文献出处:
引用格式:
[1]王雨娜;吴冬桂;赵贝-.基于数据挖掘AGR2在胰腺癌中的表达及预后潜力)[J].医学信息,2022(22):9-16
A类:
共表达蛋白组
B类:
AGR2,前梯度蛋白,胰腺组织,胰腺癌组织,GEO,数据库分析,染色体定位,Oncomine,GEPIA2,挖掘出,癌病,病理分期,String,癌症基因,靶蛋白,GeneMANIA,调控通路,UALCAN,分析条件,甲基化,生存预后,正常组织,表达比较,共表达基因,基因分析,S100P,CDC25B,RAS,HER3,泛素化,Wnt,预后评估,有效靶点,差异表达基因
AB值:
0.269947
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