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典型文献
Roux-en-Y胃旁路术前后肥胖症患者肌肉组织的差异表达基因和药物靶点分析
文献摘要:
目的 分析Roux-en-Y胃旁路术(RYGB)对肥胖症患者肌肉组织基因表达的影响,探讨肥胖症的潜在治疗靶点.方法 筛选GEO数据库,下载GSE161643数据集,获得RYGB术后肥胖症患者肌肉组织的差异表达基因,进行富集分析和免疫细胞浸润分析,构建靶点-化合物相互作用网络,筛选出关键靶点,并利用CMap数据库寻找可治疗肥胖症的潜在候选药物.结果 本研究共筛选出RYGB术后肌肉组织差异表达基因74个,其中上调基因30个、下调基因44个.基因集富集分析结果提示,GSE161643数据集富集于mRNA加工、RNA剪接、mRNA加工的调控、RNA剪接的调控等8个GO功能.京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示,GSE161643数据集富集于单纯疱疹病毒1型感染通路.RYGB术后,肌肉组织样本的基质成分评分、免疫成分评分与RYGB术前比较,差异均无统计学意义(P>0.05).靶点-化合物相互作用网络共筛选出10个关键靶点,分别为 UBC、CDK1、ERBB2、CDK2、CHEK2、CDC25A、ERBB3、SHC1、CHEK1 和 BTRC.CMap 数据库共筛选出共同作用于UBC、CDK1、ERBB2的小分子化合物9个,分别为氯吡格雷、BNTX、香豆素、左氧氟沙星、SID-26681509、依折麦布、异丁香酚、渥曼青霉素和PSB-06126.结论 与RYGB术前相比,肥胖症患者RYGB术后的肌肉组织基因表达存在显著差异,这些差异可能成为治疗肥胖症的潜在药物靶点.
文献关键词:
肥胖症;Roux-en-Y胃旁路术;肌肉组织;差异表达基因;生物信息学;药物靶点
作者姓名:
林艺;郑建伟;俞巍;冯国勋;闫文貌;白日星
作者机构:
首都医科大学附属北京天坛医院普通外科,,北京,100070;首都医科大学附属北京天坛医院肿瘤综合治疗中心,北京,100070
引用格式:
[1]林艺;郑建伟;俞巍;冯国勋;闫文貌;白日星-.Roux-en-Y胃旁路术前后肥胖症患者肌肉组织的差异表达基因和药物靶点分析)[J].实用临床医药杂志,2022(16):30-35,41
A类:
GSE161643,SHC1,BNTX
B类:
Roux,en,胃旁路术,肥胖症,肌肉组织,差异表达基因,药物靶点,RYGB,潜在治疗,治疗靶点,GEO,下载,免疫细胞浸润,相互作用网络,关键靶点,CMap,候选药物,组织差异表达,基因集富集分析,剪接,京都基因与基因组百科全书,单纯疱疹病毒,质成,UBC,CDK1,ERBB2,CDK2,CHEK2,CDC25A,ERBB3,CHEK1,BTRC,小分子化合物,氯吡格雷,香豆素,左氧氟沙星,SID,依折麦布,异丁香酚,渥曼青霉素,PSB,潜在药物
AB值:
0.268597
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