典型文献
肺腺癌预后相关关键基因的生物信息学分析
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法对人类肺腺癌肿瘤组织与正常癌旁组织的差异表达基因(DEGs)进行筛选和分析,筛选出肺腺癌发生、发展的关键基因——Hub基因,并为后续研究提供候选基因.方法 从GEO数据库中下载肺腺癌基因芯片数据集——GSE63459和GSE27262,利用GEO2R筛选人类肺腺癌肿瘤组织与正常癌旁组织的DEGs,然后利用DAVID数据库对DEGs进行基因本体富集分析,KOBAS数据库进行KEGG通路富集分析,利用STRING数据库、Cytoscape软件构建蛋白互作网络并筛选Hub基因,再利用On-comine数据库对Hub基因进行进一步筛选,最后使用Kaplan-Meier plotter数据库进行生存分析.结果 共筛选出22个明显上调的DEGs,筛选出E-钙黏蛋白1、人类表皮生长因子受体、细胞酪氨酸激酶3个Hub基因,3个Hub基因与肺腺癌患者总体生存期明显相关.结论 E-钙黏蛋白1、人类表皮生长因子受体、细胞酪氨酸激酶3个H ub基因可能与人类肺腺癌的发生、发展密切相关,可能是肺腺癌发病机制、预后判断和治疗研究的新靶点.
文献关键词：
肺肿瘤;腺癌;预后;关键基因;生物信息学;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
温海燕;朱玉坤;曹立宇
作者机构：
安徽医科大学附属阜阳医院病理科,安徽阜阳 236000
文献出处：
引用格式：
[1]温海燕;朱玉坤;曹立宇-.肺腺癌预后相关关键基因的生物信息学分析)[J].现代医药卫生,2022(12):2000-2004
A类：
GSE63459,GSE27262,comine,ub
B类：
关键基因,生物信息学分析,利用生物,生物信息学方法,癌肿,肿瘤组织,癌旁组织,差异表达基因,DEGs,Hub,候选基因,下载,癌基因,基因芯片,GEO2R,选人,DAVID,基因本体,KOBAS,通路富集分析,STRING,Cytoscape,软件构建,蛋白互作网络,On,Kaplan,Meier,plotter,生存分析,钙黏蛋白,人类表皮生长因子受体,酪氨酸激酶,肺腺癌患者,总体生存期,预后判断,治疗研究,新靶点,肺肿瘤
AB值：
0.282111
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