典型文献
基于生物信息学分析筛选与宫颈癌预后相关的关键基因
文献摘要：
目的 基于生物信息学筛选与宫颈癌预后相关的关键基因,寻找新的宫颈癌预后的生物标志物.方法 对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的CESC数据集和基因表达总表(GEO)数据库中的GSE39001数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),通过构建PPI网络,筛选出与宫颈癌预后相关的关键基因,分析关键基因在宫颈癌中的表达情况、预后和功能作用,并进行验证.结果 共筛选出69个宫颈癌差异基因,这些基因主要参与细胞有丝分裂和细胞周期调控;PPI筛选出10个与宫颈癌相关的关键基因,均表达上调,其中KIF22的高表达与宫颈癌的预后良好相关(P<0.05);构建KIF22生存预测模型,5年生存率的ROC曲线的AUC值为0.612;Western Blot检测宫颈癌组中KIF22的表达,结果显示,与癌旁正常宫颈组织相比,KIF22在宫颈癌组织中表达上调(P<0.05);功能富集结果显示,KIF22高表达与p53通路显著富集.结论 KIF22在宫颈癌组织中高表达,其可能是宫颈癌患者预后良好的关键基因,有可能成为一种潜在的治疗靶点和预后生物标志物.
文献关键词：
宫颈癌;差异基因;生物标记物;细胞周期
中图分类号：
作者姓名：
覃念群;刘楷;米镜霖;张勇
作者机构：
广西医科大学第一附属医院放疗科,广西 南宁 530021;广西区域性高发肿瘤早期防治研究重点实验室,广西 南宁 530021
文献出处：
引用格式：
[1]覃念群;刘楷;米镜霖;张勇-.基于生物信息学分析筛选与宫颈癌预后相关的关键基因)[J].医学信息,2022(10):8-13
A类：
GSE39001,KIF22
B类：
生物信息学分析,关键基因,癌症基因组图谱,TCGA,CESC,总表,GEO,加权基因共表达网络分析,WGCNA,PPI,功能作用,差异基因,有丝分裂,细胞周期,周期调控,生存预测模型,Blot,癌旁,正常宫颈组织,宫颈癌组织,组织中表达,功能富集,集结,p53,宫颈癌患者,治疗靶点,预后生物标志物,生物标记物
AB值：
0.234488
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