典型文献
基于芍药转录组挖掘芍药苷生物合成相关基因
文献摘要：
芍药苷是中药白芍、赤芍的主要活性成分,也是两者质量控制的指标成分之一.芍药苷属于蒎烷型三环单萜苷类化合物,其生物合成主要通过MEP和MVA途径生成单萜共同前体GPP,再在萜类合酶、细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)、尿苷二磷酸糖基转移酶(UDP-glucuronosyltransferase,UGT)以及酰基转移酶(acyltransferase,AT)的催化下形成具有活性的芍药苷.为挖掘芍药苷生物合成相关基因,该研究构建芍药Paeonia lactiflora花、叶和根3个部位的cDNA文库进行测序,共获得30 609条ORF.该研究对转录组中的所有CYP450基因进行功能注释分析及表达量分析,筛选出属于CYP71A、CYP71D亚家族且与单萜合酶PlPIN表达趋势一致的11条可能参与芍药苷生物合成的CYP450基因;后续又通过功能注释分析、序列全长分析、基因表达量分析、系统进化树分析进一步筛选得到与PlPIN表达相一致的且可能参与芍药苷生物合成的UGT基因7条及AT基因9条.该研究提供了一个系统的分析筛选方法并大大缩小了候选基因的数量,减少功能基因验证的工作量,为芍药苷生物合成途径解析及其形成机制奠定基础.
文献关键词：
芍药;芍药苷;转录组;CYP450;尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT);酰基转移酶(AT)
中图分类号：
作者姓名：
郭文鼎;胡志敏;卜俊玲;王健;马莹;郭娟;黄璐琦
作者机构：
中国中医科学院中药资源中心,北京100700
文献出处：
引用格式：
[1]郭文鼎;胡志敏;卜俊玲;王健;马莹;郭娟;黄璐琦-.基于芍药转录组挖掘芍药苷生物合成相关基因)[J].中国中药杂志,2022(16):4347-4357
A类：
glucuronosyltransferase,CYP71A,CYP71D,PlPIN
B类：
转录组,芍药苷,白芍,赤芍,主要活性成分,指标成分,三环,单萜苷,苷类,类化合物,MEP,MVA,成单,同前,GPP,萜类合酶,细胞色素,cytochrome,CYP450,尿苷二磷酸糖基转移酶,UDP,UGT,酰基,acyltransferase,AT,研究构建,Paeonia,lactiflora,叶和根,cDNA,文库,共获,ORF,功能注释,表达量分析,亚家族,全长,基因表达量,系统进化树分析,选得,相一致,筛选方法,候选基因,功能基因,生物合成途径
AB值：
0.326902
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