典型文献
地黄全长转录组测序及苯乙醇苷合成途径催化酶基因鉴定
文献摘要：
地黄为玄参科药用植物,具有重要的药用价值.为了有效发掘地黄的转录组信息,鉴定参与苯乙醇苷(PhGs)类成分生物合成的催化酶基因,本研究以地黄的叶、茎和块根为材料利用Pacific Biosiences RSⅡ平台进行测序.共获得非冗余的转录本27 773条,平均长度2 380 bp,预测出27 236个蛋白编码序列(CDS:coding sequence).利用BLAST等软件在NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro等数据库共预测到27 399个注释的基因.NR注释表明,与地黄转录本匹配数量最多的是芝麻(Sesamum indicum),有81.44％,这与它们进化上的亲缘关系一致.推测了参与异毛蕊花糖苷、松果菊苷、肉苁蓉苷A、肉苁蓉苷F、2'-乙酰毛蕊花糖苷和leonoside F生物合成的催化酶,并鉴定出143个参与苯乙醇苷类成分生物合成的转录本.19个催化酶基因在地黄12个组织中与毛蕊花糖苷的含量呈正相关,其中多数基因在叶和花中具有较高的表达量.研究结果为地黄功能基因的挖掘提供了可靠的转录组数据,为苯乙醇苷类成分生物合成的分子机制研究提供了依据.
文献关键词：
地黄;苯乙醇苷;全长转录组;毛蕊花糖苷;表达特性
中图分类号：
作者姓名：
王丰青;杨旭;左鑫;苗春妍;张重义
作者机构：
河南农业大学农学院,河南郑州450002;福建农林大学农学院,福建福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]王丰青;杨旭;左鑫;苗春妍;张重义-.地黄全长转录组测序及苯乙醇苷合成途径催化酶基因鉴定)[J].药学学报,2022(03):831-838
A类：
PhGs,Biosiences,Interpro,leonoside
B类：
地黄,全长转录组测序,合成途径,催化酶,酶基因,基因鉴定,玄参科,药用植物,药用价值,分生,生物合成,块根,Pacific,RS,共获,非冗余,转录本,平均长度,bp,预测出,蛋白编码,编码序列,CDS,coding,sequence,BLAST,NR,NT,COG,Swissprot,匹配数,芝麻,Sesamum,indicum,亲缘关系,异毛蕊花糖苷,松果菊苷,肉苁蓉,苯乙醇苷类成分,功能基因,转录组数据,表达特性
AB值：
0.320162
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