典型文献
枫香C4H基因的克隆及生物信息学分析
文献摘要：
肉桂酸-4-羟基化酶(cinnamate 4-hydroxylase,C4H)是花色素苷合成过程第二步中的重要酶.以变色期枫香叶片为试验材料,根据前期研究获得的枫香叶片RNA-Seq数据库中筛选的C4H基因序列设计一对引物,利用RT-PCR技术克隆C4H核苷酸序列,命名为LfC4Hb;将基因上传至GenBank数据库获得枫香C4H基因的登录号(OL871170),并对其进行生物信息学分析.结果显示:枫香LfC4Hb基因长度为1551 bp,包含一个1518 bp的完整开放阅读框,编码505个氨基酸;保守结构域分析显示,LfC4Hb基因编码的蛋白包含一个p450家族蛋白的结构域,分子量为58.00 kDa,理论等电点为9.13,为亲水性的不稳定蛋白质,定位在内质网,存在多个磷酸化位点,无信号肽,不含有跨膜结构域,蛋白的二级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲,LfC4Hb基因在氨基酸水平与莲同源性最高(94.5％);进化分析结果表明,LfC4Hb与青脆枝亲缘关系相对较近.本研究成功克隆了枫香C4H基因,并分析了LfC4Hb 的蛋白质结构功能,对下一步利用基因工程技术进行枫香叶色调控及新品种培育具有重要意义.
文献关键词：
枫香;肉桂酸-4-羟基化酶;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
刘雄盛;尹国平;肖玉菲;王仁杰;黄荣林;王勇
作者机构：
广西壮族自治区林业科学研究院/广西优良用材林资源培育重点实验室 广西南宁530002
文献出处：
引用格式：
[1]刘雄盛;尹国平;肖玉菲;王仁杰;黄荣林;王勇-.枫香C4H基因的克隆及生物信息学分析)[J].热带农业科学,2022(06):45-52
A类：
LfC4Hb,OL871170
B类：
生物信息学分析,肉桂酸,羟基化,cinnamate,hydroxylase,花色素苷,合成过程,第二步,变色,枫香叶,前期研究,Seq,基因序列,序列设计,引物,GenBank,登录号,bp,开放阅读框,保守结构域,基因编码,白包,p450,分子量,kDa,等电点,亲水性,内质网,磷酸化,信号肽,跨膜结构域,二级结构,无规则,卷曲,同源性,进化分析,亲缘关系,蛋白质结构,结构功能,基因工程技术,叶色,色调,新品种培育,基因克隆
AB值：
0.314209
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