典型文献
橡胶树HbREF3基因的克隆及功能初步分析
文献摘要:
橡胶延伸因子(REFs)是橡胶粒子上的一种主要膜蛋白,在橡胶生物合成途径中具有延伸橡胶烃和稳定橡胶粒子等重要作用.对橡胶树不同组织的转录组测序发现,HbREF3在胶乳中具有特异性的高表达,且其在HbREFs基因家族中表达水平也相对较高,仅次于表达丰度最高的HbREF1.HbREF3的开放阅读框为528 bp,编码175个氨基酸,对应的蛋白相对分子质量为19.62 kDa,理论等电点(pI)为5.28.系统进化树分析表明,HbREF3与橡胶树其他HbREFs虽均属于分组Ⅰ,但与HbREF1明显属于不同分支.HbREFs均含有REF保守结构域,但在保守motif的分布上,不同HbREFs蛋白含有保守motif数量不等,HbREF3比HbREF1多了一个motif.生信预测分析表明,该蛋白属于亲水性蛋白,无跨膜结构域,具有14个磷酸化位点.亚细胞定位分析发现HbREF3蛋白定位在内质网上,推测其可能参与橡胶粒子的形成和胶乳的再生.本研究结果为进一步阐明HbREF3基因在橡胶树胶乳再生中的作用机制奠定了基础.
文献关键词:
橡胶树;橡胶延伸因子HbREF3;生物信息学分析;亚细胞定位
中图分类号:
作者姓名:
录亿隆;刘星;张宇豪;刘开业;唐朝荣
作者机构:
海南大学热带作物学院/天然橡胶省部共建协同创新中心,海南海口 570228
文献出处:
引用格式:
[1]录亿隆;刘星;张宇豪;刘开业;唐朝荣-.橡胶树HbREF3基因的克隆及功能初步分析)[J].热带作物学报,2022(03):491-498
A类:
HbREF3,REFs,HbREFs,HbREF1
B类:
橡胶树,初步分析,延伸因子,橡胶粒子,膜蛋白,橡胶生物合成,生物合成途径,橡胶烃,不同组织,转录组测序,胶乳,基因家族,仅次于,开放阅读框,bp,白相,相对分子质量,kDa,等电点,pI,系统进化树分析,显属,保守结构域,motif,生信,预测分析,亲水性,跨膜结构域,磷酸化,亚细胞定位,定位分析,蛋白定位,内质网,树胶,生物信息学分析
AB值:
0.26293
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