典型文献
威宁短柱油茶MKK3基因克隆及生物信息学分析
文献摘要:
[目的]分离克隆威宁短柱油茶MAPKK基因家族相关基因,为挖掘威宁短柱油茶抗逆相关基因奠定基础.[方法]利用RT-PCR扩增MAPKK基因全长cDNA序列,利用生物信息学分析软件对其开放阅读框、基本理化性质、磷酸化位点及蛋白互作等进行分析.[结果]克隆获得威宁短柱油茶CsMKK3基因,全长2 219 bp,包含1个1 557 bp的开放阅读框,编码518个氨基酸,蛋白的相对分子量为57 524.61 Da,理论等电点5.44,是无跨膜结构和信号肽的不稳定蛋白,定位于细胞核,含有多个磷酸化位点,与MAPK蛋白激酶家族的MPK2、MPK14、MPK1、MPK8、MPK5、MPK7及MPK6等蛋白存在相互作用;系统进化分析其与同科植物茶亲缘关系最近.[结论]克隆分离的CsMKK3基因符合MAPKK基因家族特征,属于该基因家族成员.
文献关键词:
威宁短柱油茶;CsMKK3基因;基因克隆;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
郑庆梅;徐嘉娟;杨冰;霍达;朱亚艳;许杰;王港
作者机构:
赤水市木司国有林场,贵州赤水564700;贵州省林业科学研究院,贵州贵阳550005
文献出处:
引用格式:
[1]郑庆梅;徐嘉娟;杨冰;霍达;朱亚艳;许杰;王港-.威宁短柱油茶MKK3基因克隆及生物信息学分析)[J].贵州农业科学,2022(11):107-113
A类:
MKK3,MAPKK,CsMKK3,MPK2,MPK14,MPK1,MPK8,MPK5,MPK7
B类:
威宁短柱油茶,基因克隆,生物信息学分析,基因家族,抗逆,全长,cDNA,利用生物,开放阅读框,基本理化性质,磷酸化,蛋白互作,bp,相对分子量,Da,等电点,膜结构,信号肽,细胞核,蛋白激酶,MPK6,系统进化分析,同科,亲缘关系
AB值:
0.199956
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。