典型文献
基于转录组的糙苏MYB转录因子的挖掘及分析
文献摘要：
本研究基于糙苏的转录组数据库,挖掘参与糙苏生长发育及次生代谢产物合成相关的MYB转录因子,对糙苏MYB转录因子的理化性质、 氨基酸序列及保守基序、 高级结构、 系统进化树进行挖掘和生物信息学分析,并结合GO注释、 蛋白质功能预测和表达模式进行深入分析.从糙苏转录组数据中共挖掘出61条具有完整MYB保守结构域的转录因子序列;系统进化分析结果显示,糙苏MYB转录因子可能参与糙苏黄酮类物质的生物合成,在生长发育过程及抗逆性胁迫中起作用;GO注释分析表明,糙苏MYB转录因子家族蛋白在生物学过程中主要参与糙苏的细胞过程和生物调节过程;PuMYB7、PuMYB10、PuMYB34、PuMYB40、PuMYB42、PuMYB43参与了植物萜类代谢生物途径;表达分析显示,PuMYB48、PuMYB51、PuMYB9、PuMYB17、PuMYB56可能参与糙苏根部木质素的生物合成和次生生长等过程.
文献关键词：
糙苏;转录组;MYB转录因子
中图分类号：
作者姓名：
熊勇;赵春艳;李晓艳
作者机构：
云南民族大学 民族医药学院, 云南 昆明 650500;中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所, 云南 昆明 650221
文献出处：
引用格式：
[1]熊勇;赵春艳;李晓艳-.基于转录组的糙苏MYB转录因子的挖掘及分析)[J].浙江农业科学,2022(08):1689-1698
A类：
PuMYB7,PuMYB10,PuMYB34,PuMYB40,PuMYB42,PuMYB43,PuMYB48,PuMYB51,PuMYB9,PuMYB17,PuMYB56
B类：
糙苏,转录组数据,次生代谢产物,产物合成,氨基酸序列,保守基序,系统进化树,生物信息学分析,蛋白质功能预测,表达模式,挖掘出,保守结构域,子序列,系统进化分析,苏黄,黄酮类物质,生物合成,抗逆性,胁迫,生物学过程,萜类代谢,生物途径,表达分析,根部,木质素
AB值：
0.204877
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