典型文献
盐碱胁迫下平邑甜茶的转录组分析
文献摘要：
为了解平邑甜茶对盐碱胁迫的响应机制,利用RNA-seq技术检测了盐碱胁迫下其幼苗的基因表达水平.结果显示,每个样品平均产出6.48 Gb数据,43.82×106个原始数据;纯净数据为42.71×106～43.44×106个,表达的基因数为41008,其中已知的基因为38465个,预测的新基因为2543个.基因表达量聚类分析显示,根和叶中的基因分别聚类成12个基因簇,并对根中基因簇1、7、9、10、11以及叶中基因簇4、7、8、10进行了GO和KEGG富集分析.GO富集分析结果显示,生物过程中的基因主要富集于细胞过程和代谢过程中,细胞组分中的基因主要富集于膜、膜部分、细胞和细胞器中,分子功能中的基因主要富集于结合和催化活性中;KE GG富集分析显示,根和叶中富集基因较多的途径有内质网内蛋白质加工、碳代谢、氨基酸的生物合成、核糖体、RN A转运、植物激素信号转导等.进一步分析表明,叶绿素a/b结合蛋白、查尔酮合成酶、查尔酮-黄酮异构酶、热休克蛋白、转录因子、细胞色素P450蛋白和未知蛋白等编码基因参与了平邑甜茶对盐碱胁迫的响应,并发挥了重要的调节作用.本研究有助于进一步了解平邑甜茶对混合耐盐碱胁迫响应的分子机制,为今后苹果砧木抗盐碱分子育种提供参考.
文献关键词：
平邑甜茶;盐碱胁迫;转录组;基因表达;胁迫响应
中图分类号：
作者姓名：
王新亮;彭玲;王健;贾晶晶;唐立平
作者机构：
滨州学院学报编辑部,山东滨州256603;滨州学院山东省黄河三角洲生态环境重点实验室,山东滨州256603
文献出处：
引用格式：
[1]王新亮;彭玲;王健;贾晶晶;唐立平-.盐碱胁迫下平邑甜茶的转录组分析)[J].江苏农业科学,2022(22):29-37
A类：
B类：
盐碱胁迫,平邑甜茶,转录组分析,响应机制,seq,幼苗,基因表达水平,Gb,原始数据,纯净,净数,新基因,基因表达量,基因簇,富集分析,生物过程,代谢过程,细胞器,催化活性,中富,内质网,网内,蛋白质加工,碳代谢,生物合成,核糖体,植物激素,激素信号,信号转导,叶绿素,结合蛋白,查尔酮合成酶,黄酮,异构酶,热休克蛋白,细胞色素,P450,编码基因,耐盐碱,胁迫响应,苹果砧木,抗盐,分子育种
AB值：
0.306437
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