典型文献
蒙古冰草ERF转录因子生物信息学及其表达分析
文献摘要：
ERF(Ethylene responsive factor)家族是植物中一种重要的转录因子,参与植物生长发育和逆境胁迫响应.为筛选蒙古冰草(A gropyron mongolicum Keng)抗旱相关的ERF转录因子,本研究利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及其二、三级结构进行分析,同时对不同干旱处理下的ERF基因进行表达分析.结果显示:筛选得到18个具有ERF结构特征的蒙古冰草ERF转录因子,蛋白大小在70～404 aa之间,分子质量在7447.54～43654.9之间,理论等电点(PI)在4.53～11.10之间,其中有2个疏水性蛋白,其余均为亲水性蛋白,大部分定位于细胞核.ERF转录因子的二、三级结构以无规则卷曲为主,推测motif1,motif2,motif3为保守基序.进化关系比对发现AmERF053,AmERF1B,AmERF4-1,AmERF4-2与已知具有抗旱功能的蛋白具有较高同源性,且在干旱处理的蒙古冰草中显著差异表达.
文献关键词：
蒙古冰草;ERF转录因子;抗旱;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
吴婧;范菠菠;张学峰;宋金微;房永雨;于卓;闫秀秀;赵彦;马艳红
作者机构：
内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010019;内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古呼和浩特010031;内蒙古农业大学草原与资源环境学院,内蒙古呼和浩特010018
文献出处：
引用格式：
[1]吴婧;范菠菠;张学峰;宋金微;房永雨;于卓;闫秀秀;赵彦;马艳红-.蒙古冰草ERF转录因子生物信息学及其表达分析)[J].草地学报,2022(11):2910-2921
A类：
gropyron,AmERF053,AmERF1B,AmERF4
B类：
蒙古冰草,表达分析,Ethylene,responsive,植物生长发育,逆境胁迫响应,mongolicum,Keng,抗旱,旱相,研究利用,利用生物,生物信息学方法,亚细胞定位,保守基序,进化关系,三级结构,旱处理,选得,aa,分子质量,等电点,疏水性,亲水性,细胞核,无规则,卷曲,motif1,motif2,motif3,同源性,差异表达,生物信息学分析
AB值：
0.299691
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