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苦茶碱代谢关键转录因子基因的筛选鉴定
文献摘要：
苦茶是我国特异的茶树资源,主要分布于西南地区,富含苦茶碱(1,3,7,9-四甲基尿酸).苦茶碱具有镇静、催眠和抗抑郁等多种生理活性,其合成关键基因(苦茶碱合成酶基因)已经得到克隆和研究,但是苦茶碱代谢调控机制的研究鲜有报道.为了挖掘与苦茶碱代谢调控相关的转录因子,本研究以高苦茶碱(GKC)、低苦茶碱(LKC)茶树品种以及常规茶树品种(YK10)为研究对象,通过HPLC和RNA-seq分别就样品的嘌呤生物碱含量和基因表达情况进行分析,并通过荧光定量PCR验证了转录组数据的可靠性.结果表明,GKC和LKC的苦茶碱含量分别为21.82 mg·g-1和14.70 mg·g-1,而YK10中检测不到苦茶碱,另外,GKC和LKC的咖啡碱含量均低于15.00 mg·g-1;通过RNA-seq方法,获得了3948个GKC vs YK10和LKC vs YK10共同的且表达趋势一致的差异基因,这些差异基因是分属29个家族的96个转录因子,通过分析最终确定30个候选转录因子,尤其是属于NAC和HD-ZIP转录因子家族的CSS0012182、CSS0013789、CSS0041233、novel.16084和CSS0014547等转录因子可能是参与苦茶碱代谢调控的关键基因.
文献关键词：
苦茶;苦茶碱;RNA测序;转录因子
中图分类号：
作者姓名：
刘玉飞;庞丹丹;李友勇;蒋会兵;田易萍;孙云南;陈林波
作者机构：
云南省农业科学院茶叶研究所,云南 勐海 666201;云南省茶学重点实验室,云南 勐海 666201
文献出处：
引用格式：
[1]刘玉飞;庞丹丹;李友勇;蒋会兵;田易萍;孙云南;陈林波-.苦茶碱代谢关键转录因子基因的筛选鉴定)[J].茶叶科学,2022(01):41-50
A类：
GKC,LKC,YK10,CSS0012182,CSS0013789,CSS0041233,CSS0014547
B类：
苦茶碱,关键转录因子,筛选鉴定,茶树资源,西南地区,尿酸,镇静,催眠,抗抑郁,生理活性,关键基因,合成酶基,酶基因,代谢调控,调控机制,茶树品种,HPLC,seq,嘌呤生物碱,碱含量,转录组数据,检测不到,咖啡碱,差异基因,分属,NAC,HD,ZIP,novel
AB值：
0.17592
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