构建IgE介导的大鼠嗜碱性粒细胞(rat basophilic leukemia,RBL)-2H3作为过敏反应细胞模型,并利用转录组测序分析比较RBL-2H3细胞激活前后的转录组基因差异,富集相关信号通路.IgE介导的RBL-2H3细胞激活后,过敏介质和细胞因子分泌显著提高;转录组测序得到RBL-2H3细胞激活前后的232个差异表达基因,其中有127个(54.74％)可进行基因功能注释;RBL-2H3细胞激活主要影响肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶、Janus激酶-信号转导与转录激活子、Toll样受体等信号通路,涉及的转录因子有MAP3K8、Nfkbia、Junb、Jun、Fos等.本研究建立了IgE介导的过敏反应体外细胞模型,并且通过对效应细胞转录组信息的全面分析和潜在靶点及信号通路的富集为过敏性疾病的防控治疗提供参考.

过敏反应;大鼠嗜碱性粒细胞;转录组测序;差异表达基因;信号通路

集美大学海洋食品与生物工程学院,福建省海洋功能食品工程技术研究中心,福建厦门 361021

[1]刘艳;谷福蝶;陈慧莹;李焱;周钰;张军;刘红;曹敏杰;刘光明;刘庆梅-.基于RBL-2H3模型分析过敏反应效应细胞激活的差异基因)[J].食品科学,2022(22):105-112

大鼠嗜碱性粒细胞,basophilic,MAP3K8,Junb

RBL,2H3,过敏反应,效应细胞,细胞激活,差异基因,IgE,rat,leukemia,细胞模型,转录组测序分析,细胞因子分泌,差异表达基因,基因功能注释,丝裂原活化蛋白激酶,Janus,信号转导与转录激活子,Toll,样受体,Nfkbia,Fos,体外细胞,潜在靶点,集为,过敏性疾病

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