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茶树全基因组生长素反应因子(ARF)基因家族鉴定及表达分析
文献摘要：
生长素反应因子(Auxin response factor)作为调控生长素应答基因表达的转录因子,对调控植物生长发育起着十分重要的作用.研究结合茶树基因组数据,使用生物信息学分析,共鉴定出25个ARF基因,并将其命名为CsARF1～CsARF25.可将它划分入5个亚族,同一亚族内的基序和保守结构域相对保守.通过对CsARF顺势作用元件的分析,发现其可能参与茶树对逆境胁迫的响应和调控茶树的生长发育.通过转录组基因表达情况分析,CsARF在茶树不同组织的表达情况有很大区别,从一定程度上说明了CsARF参与调控茶树的生长发育,qRT-PCR验证分析结果趋势与转录组数据基本一致,也从侧面验证了这一结果.研究结果可为茶树ARF基因家族的进一步研究提供理论依据和参考.
文献关键词：
茶树;ARF基因家族;基因表达分析
中图分类号：
作者姓名：
田时雨;张蓓林;雷阳;封闻;吕立堂
作者机构：
贵州农业职业学院,贵州 贵阳 551499;贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;贵州建设职业技术学院,贵州 贵阳 551400;衢州市绿峰工贸有限公司,浙江 衢州 324000
文献出处：
引用格式：
[1]田时雨;张蓓林;雷阳;封闻;吕立堂-.茶树全基因组生长素反应因子(ARF)基因家族鉴定及表达分析)[J].中国茶叶,2022(06):37-46
A类：
CsARF1,CsARF25,CsARF
B类：
茶树,全基因组,生长素,基因家族鉴定,Auxin,response,应答基因,植物生长发育,基因组数据,生物信息学分析,基序,保守结构域,顺势作用元件,逆境胁迫,不同组织,qRT,验证分析,转录组数据,基因表达分析
AB值：
0.236126
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