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典型文献
葡萄耐铝毒基因STOP1的克隆与表达分析
文献摘要:
[目的]STOP1是植物耐铝毒的重要基因,为探明葡萄STOP1基因的结构特征及其表达量与其耐铝性的关系.[方法]以耐铝性弱的山葡萄(Vitis amurensis)和耐铝性强的小叶葡萄(V.sinocinerea)的叶片cDNA为模板,采用PCR和TA克隆技术获得VaSTOP1和VsSTOP1两基因序列,对其进行生物信息学分析和铝胁迫下的表达分析,并测定铝胁迫下的膜脂过氧化指标,对2个种STOP1基因的表达和膜脂过氧化物质的变化与耐铝性的关系进行比较.[结果]克隆获得的VaSTOP1和VsSTOP1基因序列长度分别为1782和1800 bp,分别编码594和600个氨基酸,相对分子量分别为67.03和67.48 kD,理论等电点为5.21和6.42;二者的二级结构中均有无规则卷曲>α-螺旋>折叠延伸链的规律,由α-螺旋、β-折叠片、β-转角和锌指结构等组成三级空间结构;进化树研究得出,VaSTOP1与VsSTOP1的同源性高达96%,二者与CcSTOP1、PnSTOP1、NtSTOP1、ErSTOP1的同源性均在80%以上.VaSTOP1基因表达量在铝胁迫28 d内呈先上升后下降的规律,较早出现峰值,而VsSTOP1基因表达量则稳定上升,这与二者的膜脂过氧化物质的变化规律基本一致.[结论]葡萄的耐铝性与其STOP1基因的表达量呈正相关,研究为进一步探明葡萄耐铝毒的分子调控机制提供了基因资源.
文献关键词:
葡萄;STOP1基因;序列分析;基因表达;铝毒
作者姓名:
张永福;徐仕琴;陈姣;杨砚斌;任禛
作者机构:
昆明学院农学与生命科学学院,昆明 650214
文献出处:
引用格式:
[1]张永福;徐仕琴;陈姣;杨砚斌;任禛-.葡萄耐铝毒基因STOP1的克隆与表达分析)[J].西南农业学报,2022(03):588-595
A类:
STOP1,sinocinerea,VaSTOP1,VsSTOP1,CcSTOP1,PnSTOP1,NtSTOP1,ErSTOP1
B类:
耐铝毒,克隆与表达,表达分析,耐铝性,山葡萄,Vitis,amurensis,小叶,cDNA,TA,克隆技术,技术获得,两基,基因序列,生物信息学分析,铝胁迫,膜脂过氧化,过氧化指标,bp,分别编,相对分子量,kD,等电点,二级结构,无规则,卷曲,折叠,叠片,锌指,进化树,同源性,基因表达量,先上,稳定上升,分子调控机制,基因资源,序列分析
AB值:
0.247677
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