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典型文献
广丰千金薯和铁棍山药脱毒微型块茎的转录组分析
文献摘要:
为探究广丰千金薯和铁棍山药在分子水平的差异,以广丰千金薯(QJS)和铁棍山药(TGSY)试管苗的微型块茎为试验材料进行转录组分析.结果表明:QJS组和TGSY组样本间相关系数为0.42.QJS组和TG-SY组表达量FPKM的对数值在0~1.5,表达量密度在0~1.0.与TGSY组相比,QJS组有4765个基因下调,有5112个基因上调.QJS组和TGSY组表达的共有基因有25207个,QJS组单独表达的基因有5261个,TGSY组单独表达的基因有3571个.QJS组和TGSY组共发现611498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和12056个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR).与TGSY组相比,QJS组的淀粉合成酶3、α-淀粉酶3、β-淀粉酶、类黄酮3′-单加氧酶、类黄酮3′-羟化酶、花青素合酶等基因上调,而颗粒结合淀粉合酶2、蔗糖合酶1、扩展蛋白2和苯丙氨酸解氨酶等基因下调.这可能是广丰千金薯微型块茎肉质绵密粉嫩、软糯爽口、胁迫防御、食后易胀的内在原因.结果可以为广丰千金薯的品种鉴定和分子育种提供参考.
文献关键词:
广丰千金薯;铁棍山药;脱毒;微型块茎;转录组分析
作者姓名:
尹明华;白丽;陈舒敏;程佳慧;冯丽文
作者机构:
上饶师范学院 生命科学学院,江西 上饶 334001;上饶农业技术创新研究院,江西 上饶 334001;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西 上饶 334001;上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,江西 上饶 334001
文献出处:
引用格式:
[1]尹明华;白丽;陈舒敏;程佳慧;冯丽文-.广丰千金薯和铁棍山药脱毒微型块茎的转录组分析)[J].浙江农业学报,2022(10):2209-2219
A类:
广丰千金薯,微型块茎,QJS,TGSY
B类:
铁棍山药,脱毒,转录组分析,分子水平,试管苗,FPKM,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,SNP,简单重复序列,simple,sequence,repeats,SSR,淀粉合成酶,淀粉酶,类黄酮,单加氧酶,羟化酶,花青素,颗粒结合淀粉合酶,蔗糖合酶,扩展蛋白,苯丙氨酸解氨酶,肉质,绵密,粉嫩,爽口,胁迫防御,内在原因,品种鉴定,分子育种
AB值:
0.234175
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