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典型文献
绿豆GRAS基因家族鉴定及其非生物胁迫下的表达模式分析
文献摘要:
GRAS(gibberellic acid insensitive(GAI),repressor of GAI(RGA),and scarecrow(SCR))基因家族广泛存在于植物中,对于植物响应逆境胁迫及生长、发育等方面起重要作用.绿豆(Vigna radiata)是我国传统的经济作物,抗逆性强,是盐碱土壤改良的优良作物之一.本研究鉴定出58个绿豆GRAS基因,并对这些基因进行生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式分析.结果表明,GRAS基因不均匀的分布在绿豆的1~11号染色体上;系统进化分析将GRAS基因分为8个亚家族(PAT1,DELLA,SCL3,LISCL,LS,SCR,SHR和HAM),同一亚家族的VrGRAS蛋白有相似的蛋白基序;基因结构分析发现绿豆GRAS内含子较少,在不同物种中具有较高的保守性;启动子区域含有脱落酸、乙烯、茉莉酸甲酯等激素响应元件以及胁迫响应元件;qPCR结果显示,绿豆GRAS基因在叶片中能够不同程度的响应盐、干旱、碱和低温等非生物胁迫,且表达具有组织特异性.PAT1亚家族基因对绿豆响应逆境胁迫起重要的调控作用.本研究结果可为绿豆GRAS家族基因的抗逆功能分析提供参考.
文献关键词:
绿豆;GRAS基因家族;非生物胁迫;表达模式
作者姓名:
张文慧;何光鑫;王子鑫;周鹏;徐红岩;张琦;杜吉到
作者机构:
黑龙江八一农垦大学农学院,大庆163319
引用格式:
[1]张文慧;何光鑫;王子鑫;周鹏;徐红岩;张琦;杜吉到-.绿豆GRAS基因家族鉴定及其非生物胁迫下的表达模式分析)[J].农业生物技术学报,2022(05):861-872
A类:
scarecrow,PAT1,SCL3,LISCL,VrGRAS
B类:
绿豆,基因家族鉴定,非生物胁迫,表达模式分析,gibberellic,acid,insensitive,GAI,repressor,RGA,SCR,逆境胁迫,Vigna,radiata,经济作物,抗逆性,盐碱土壤,土壤改良,生物信息学分析,系统进化分析,亚家族,DELLA,LS,SHR,HAM,基序,基因结构,内含子,保守性,启动子区域,脱落酸,茉莉酸甲酯,激素响应,响应元,胁迫响应,qPCR,有组织,组织特异性,家族基因,抗逆功能,功能分析
AB值:
0.30597
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