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超声波处理对小麦种子活力影响的转录组分析
文献摘要：
为分析超声波处理对小麦种子活力及相关基因表达的影响,设置不同时长超声波(0(CK)、10、20、30、40和50 min)处理小麦种子,同时借助转录组测序技术筛选与小麦种子活力相关的差异表达基因,进行GO分类及KEGG富集分析.结果表明,超声波处理30 min的小麦种子活力最高,且显著高于其他处理和CK.30 min处理的小麦幼苗萌发0 h的脯氨酸含量以及SOD、CAT、POD的活性均显著高于CK,萌发72 h的幼苗SOD、CAT活性与脯氨酸含量均显著高于CK.转录组分析表明,与CK相比,超声波处理30 min的小麦种子萌发0和72 h共有1 723个差异表达的基因.GO富集分析表明,在生物过程上,超声波处理对种子活力的影响主要集中在氧化还原过程、碳水化合物代谢过程、氧化应激响应与过氧化氢分解代谢过程;在细胞组分上,主要集中在胞外区、质外体、细胞壁和细胞外间隙等质膜外区域;在分子功能上,主要集中在氧化还原酶活性、单加氧酶活性和过氧化物酶活性.KEGG富集分析发现,富集最为显著的3个通路依次为谷胱甘肽代谢(ko00480)、代谢途径(ko01100)与色氨酸代谢(ko00380),其中谷胱甘肽代谢通路共富集32个差异表达基因(DEGs).
文献关键词：
超声波处理;小麦;种子活力;转录组分析
中图分类号：
作者姓名：
刘鹏飞;麦嘉琦;刘君;李坪遥;周捷成;蒋锋
作者机构：
仲恺农业工程学院农业与生物学院,广州510225;广州市特色作物种质资源研究与利用重点实验室,广州510225
文献出处：
引用格式：
[1]刘鹏飞;麦嘉琦;刘君;李坪遥;周捷成;蒋锋-.超声波处理对小麦种子活力影响的转录组分析)[J].中国农业大学学报,2022(12):116-126
A类：
ko00480,ko01100,ko00380
B类：
超声波处理,小麦种子,种子活力,转录组分析,相关基因表达,转录组测序技术,技术筛选,差异表达基因,富集分析,小麦幼苗,幼苗萌发,脯氨酸含量,CAT,POD,种子萌发,生物过程,还原过程,碳水化合物代谢,代谢过程,氧化应激响应,过氧化氢分解,分解代谢,胞外区,外体,细胞壁,细胞外间隙,质膜,外区域,氧化还原酶,单加氧酶,过氧化物酶活性,谷胱甘肽代谢,代谢途径,色氨酸代谢,中谷,代谢通路,共富集,DEGs
AB值：
0.246775
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