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甘薯块根响应长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata)侵染的转录组测序分析
文献摘要：
以不侵染黑斑病菌长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)的抗病甘薯品种南京92和感病品种徐薯18的薯块为对照组,以侵染时间1、3、7 d时的薯块为处理组进行转录组测序.测序结果表明:在抗病品种中找到36127个差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),其中上调、下调表达的基因分别有17387、18740个;在感病品种中找到44663个DEGs,其中上调、下调表达的基因分别有22928、21735个;在相同时间点抗、感品种间的R1 vs S1、R2 vs S2、R3 vs S3和R4 vs S4这4个对比组中有1057个共有DEGs.GO富集分析结果表明:甘薯长喙壳菌侵染3 d时抗、感品种中富集到的前20的GO条目均主要为细胞成分,其次为生物过程和分子调控;隶属于生物过程的单一生物代谢过程、隶属于分子功能的氧化还原酶活性和四吡咯结合,以及隶属于细胞组分的质体和细胞外围等条目在抗、感品种中均被富集到.KEGG通路富集分析结果表明:在富集的前20的KEGG信号通路中,抗、感品种中的差异基因主要被富集到代谢途径、次级代谢产物的生物合成、碳代谢、苯丙烷生物合成、柠檬酸循环/三羧酸循环以及光合作用等通路上.此外,对长喙壳菌侵染甘薯块根的抗性相关基因进行了分析,共鉴定出221个抗性相关基因,其中激酶类(kinase,KIN)基因最多,有117个,占比为52.9％.
文献关键词：
甘薯;长喙壳菌;侵染;转录组测序;抗病基因;调控机理
中图分类号：
作者姓名：
杨冬静;马居奎;唐伟;陈晶伟;高方园;张成玲;孙厚俊;谢逸萍
作者机构：
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业农村部 甘薯生物学与遗传育种重点实验室,江苏 徐州 221131
文献出处：
引用格式：
[1]杨冬静;马居奎;唐伟;陈晶伟;高方园;张成玲;孙厚俊;谢逸萍-.甘薯块根响应长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata)侵染的转录组测序分析)[J].江西农业学报,2022(07):60-69
A类：
Ceratocystis,甘薯长喙壳菌
B类：
甘薯块根,fimbriata,侵染,转录组测序分析,染黑,黑斑病,Ellis,et,Halsted,甘薯品种,抗病品种,差异表达基因,differential,expressed,genes,DEGs,种间,R1,S1,S2,R3,S3,R4,S4,中富,条目,细胞成分,生物过程,分子调控,隶属于,生物代谢,代谢过程,氧化还原酶,吡咯,通路富集分析,差异基因,代谢途径,次级代谢产物,生物合成,碳代谢,苯丙烷,柠檬酸循环,三羧酸循环,光合作用,抗性相关基因,酶类,kinase,KIN,抗病基因,调控机理
AB值：
0.342295
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