典型文献
低温胁迫下野生马齿苋转录组分析
文献摘要：
[目的]探讨马齿苋低温胁迫的机制,对低温胁迫下野生马齿苋转录本差异进行分析.[方法]马齿苋幼苗采用低温(白天10℃、14 h,晚上5℃、10 h)和适温(白天30℃、14 h,晚上25℃、10 h)处理14 d后,利用二代(RNA-Seq)和三代(Iso-Seq)转录组测序技术探讨适温处理和低温胁迫处理马齿苋的转录本差异.[结果]每个样本平均获得的干净片段为45 397 055,平均GC含量为47.48％,平均Q20和Q30分别为97.7％和93.29％.适温和低温胁迫相比共有26 621个差异表达基因(DEGs),上调的DEGs为12 045个,下调的DEGs为14 576个.GO分析发现适温和低温胁迫相比,马齿苋上调对各种光反应、叶绿素合成和光保护的基因数目显著高于其下调的基因数,而下调丙酮酸磷酸双激酶活性、金属离子转运、调节碳水化合物代谢过程和光系统反应中心I等方面基因的数目显著高于上调的基因数目;KEGG富集差异分析表明蛋白酶体、真核生物核糖体生物发生、昼夜近似节律、萜类主链生物合成及苯环氨基酸生物合成等富集丰富.[结论]GO分析暗示低温胁迫下,马齿苋明显增加了丙酮酸磷酸双激酶活性基因数目,该酶催化CO2受体磷酸烯醇式丙酮酸的再生,从而增加CO2受体的含量;但明显下调了对各种光反应、叶绿素合成的基因数目,暗示低温胁迫显著影响了马齿苋的光合作用.该研究结果可为马齿苋低温胁迫的分子机制研究提供参考.
文献关键词：
马齿苋;低温胁迫;差异表达基因;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
叶梅荣;王晓鹏;黄守程
作者机构：
安徽科技学院生命与健康科学学院,安徽凤阳 233100
文献出处：
引用格式：
[1]叶梅荣;王晓鹏;黄守程-.低温胁迫下野生马齿苋转录组分析)[J].西南农业学报,2022(12):2732-2738
A类：
B类：
低温胁迫,下野,马齿苋,转录组分析,转录本,幼苗,白天,晚上,Seq,Iso,转录组测序技术,技术探讨,胁迫处理,干净,Q20,Q30,差异表达基因,DEGs,光反应,叶绿素合成,光保护,丙酮酸,激酶活性,金属离子,离子转运,节碳,碳水化合物代谢,代谢过程,光系统,富集差异,蛋白酶体,真核生物,核糖体,生物发生,昼夜,节律,萜类,主链,生物合成,苯环,暗示,酶催化,烯醇,光合作用
AB值：
0.308711
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