典型文献
不同硬度西瓜果皮的转录组测序及相关基因表达分析
文献摘要：
为解析西瓜果皮硬度不同的相关分子机制,挖掘西瓜果皮硬度相关的关键基因提供理论基础,以生育期相似但果皮硬度差异显著的高硬度(901)4-1-1-M和低硬度BSH为试验材料,选取果皮硬度差异最大时期即西瓜授粉30 d后的果皮,利用Illumina HiSeqTM测序平台进行转录组测序分析,采用实时荧光定量的PCR技术对测序结果进行验证.结果显示,转录组测序共筛选获得1085个差异表达基因,其中,上调表达基因555个,下调表达基因530个.GO富集分析表明,1085个差异表达基因显著富集在细胞组分、分子功能和生物过程中的细胞壁、细胞外围、外部封装结构、胞外区、四吡咯骨架、氧化还原酶活性、转移酶活性、果胶酯酶活性等功能类别.KEGG富集分析表明,Cla97C04G075800、Cla97C02G044950、Cla97C09G165820、Cla97C10G195660、Cla97C01G025380等19个差异基因被注释富集程度最高的苯丙烷代谢通路,该路径最终形成木质素、5羟基愈创木酚木质素、愈创木酚木质素和对羟基苯酚木质素代谢物,qRT-PCR和转录组测序数据相关系数R2为0.791,证明转录组试验数据可靠,从转录水平解释了(901)4-1-1-M和BSH西瓜果皮硬度存在差异的原因.
文献关键词：
西瓜;果皮硬度;转录组;差异表达基因;苯丙烷;木质素
中图分类号：
作者姓名：
张敬敬;李冰;史宇凡;高秀瑞;潘秀清;宋雪;武彦荣
作者机构：
河北省农林科学院 经济作物研究所,河北 石家庄 050051
文献出处：
引用格式：
[1]张敬敬;李冰;史宇凡;高秀瑞;潘秀清;宋雪;武彦荣-.不同硬度西瓜果皮的转录组测序及相关基因表达分析)[J].华北农学报,2022(03):44-52
A类：
西瓜授粉,Cla97C04G075800,Cla97C02G044950,Cla97C09G165820,Cla97C10G195660,Cla97C01G025380
B类：
瓜果,相关基因表达,基因表达分析,果皮硬度,关键基因,生育期,高硬度,低硬度,BSH,Illumina,HiSeqTM,测序平台,转录组测序分析,差异表达基因,富集分析,生物过程,细胞壁,封装结构,胞外区,吡咯,氧化还原酶,转移酶,果胶酯酶,酯酶活性,差异基因,苯丙烷代谢,代谢通路,愈创木酚,苯酚,木质素代谢,代谢物,qRT,序数,转录水平
AB值：
0.239895
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