典型文献
基于转录组测序挖掘小麦叶片抗旱相关基因
文献摘要：
[目的]通过转录组测序分析干旱胁迫的小麦,以期挖掘小麦响应干旱胁迫的关键基因.[方法]采用高通量Illumina Hiseq 2500测序平台对郑麦366号正常生长与自然干旱处理进行测序,并对测序数据进行分析,筛选响应干旱胁迫的关键基因.[结果]两组样品中分别获得45471018、45133470个clean read片段,包含6.82 Gb、6.39 Gb碱基信息,拼接组装后,得到188334个转录本和119588个Unigenes.通过筛选共获得1207个DEGs,其中752个上调,455个下调.GO功能富集分析显示,上调的DEGs主要富集在水解酶活性、催化活性、代谢过程、甘油代谢过程、膜和细胞部分等;下调的DEGs富集在细胞器、细胞和氧化还原酶活性的最多.KEGG途径富集分析发现,DEGs显著富集于淀粉和蔗糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、光合作用-天线蛋白、光合作用、苯丙烷生物合成、乙醛酸和二羧酸代谢、甘油磷脂代谢、氨基酸代谢和光合生物中的碳固定等代谢通路.5个抗氧化酶基因的qRT-PCR结果与RNA-Seq测序结果变化趋势相一致.[结论]利用转录组测序技术获得了大量小麦抗旱相关基因,为深入研究小麦响应干旱胁迫的分子机制提供更多的基因遗传资源.
文献关键词：
小麦;干旱胁迫;RNA-Seq技术;GO功能富集;KEGG代谢通路
中图分类号：
作者姓名：
曾倩倩;刘岩;朱墨;邱宗波
作者机构：
河南师范大学生命科学学院/河南省农业微生物生态与技术国际联合实验室,河南 新乡 453007
文献出处：
引用格式：
[1]曾倩倩;刘岩;朱墨;邱宗波-.基于转录组测序挖掘小麦叶片抗旱相关基因)[J].广东农业科学,2022(02):1-8
A类：
B类：
小麦叶片,抗旱,旱相,转录组测序分析,干旱胁迫,关键基因,Illumina,Hiseq,测序平台,自然干旱,旱处理,序数,clean,read,Gb,碱基,拼接,转录本,Unigenes,过筛,共获,DEGs,功能富集分析,水解酶活性,催化活性,代谢过程,细胞器,氧化还原酶,蔗糖代谢,卟啉,叶绿素代谢,光合作用,天线,苯丙烷,生物合成,乙醛酸,二羧酸,甘油磷脂代谢,氨基酸代谢,碳固定,代谢通路,抗氧化酶,酶基因,qRT,Seq,相一致,转录组测序技术,技术获得,基因遗传,遗传资源
AB值：
0.362476
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