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典型文献
GhPHYB基因的基因组鉴定及进化分析
文献摘要:
在陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共鉴定获得2个PHYB基因,这2个基因分别分布在A10和D10亚基因组.利用生物信息学方法对这两个基因进行初步分析表明,棉花的PHYB具有其他植物PHYB相同的基序和结构域,不管是数目还是分部位置都比较一致;不同植物的PHYB氨基酸序列同源性比对及构建的进化树都显示棉花的PHYB同可可的在同源性和进化关系上都是最近,同水稻、玉米等单子叶植物的同源性及进化关系较低;基因结构的比对结果同样显示植物PHYB基因在进化上比较保守;棉花PHYB存在几十个可能磷酸化的位点,这些位点的磷酸化作用可能影响光敏色素的功能及其介导的信号通路;PHYB直系同源基因和旁系同源基因的Ka/K,比值均小于1,说明这些基因在进化过程中受到纯化选择作用.本研究结果可为陆地棉PHYB基因的深入研究提供理论基础.
文献关键词:
陆地棉基因组;PHYB基因;进化
作者姓名:
巩元勇;赵丽华;闫飞
作者机构:
攀枝花学院生物与化学工程学院,四川攀枝花617000
文献出处:
引用格式:
[1]巩元勇;赵丽华;闫飞-.GhPHYB基因的基因组鉴定及进化分析)[J].东北农业科学,2022(06):42-47,64
A类:
GhPHYB
B类:
进化分析,异源四倍体,TM,基因组数据,A10,D10,亚基因组,利用生物,生物信息学方法,初步分析,棉花,基序,结构域,不管,分部,不同植物,氨基酸序列,序列同源性,进化树,可可,进化关系,系上,水稻,单子叶植物,基因结构,几十个,磷酸化,酸化作用,光敏色素,直系同源基因,旁系,Ka,选择作用,陆地棉基因组
AB值:
0.333817
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