典型文献
草莓轻型黄边病毒中国分离物全基因组序列测定和分析
文献摘要:
草莓轻型黄边病毒(Strawberryy mild yellow edge virus,SMYEV)是引起我国草莓病毒病害的重要病毒之一,我们测定了共侵染草莓植株的2个SMYEV中国分离物FJ1和FJ2的全基因组序列.FJ1和FJ2分离物基因组全长均为5971 nt,包含5个开放阅读框(ORF),其中,FJ2分离物ORF4编码蛋白C端缺乏7aa.SMYEV分离物FJ1和FJ2的基因组核苷酸序列一致性为89.8%,两者和其他SMYEV分离物的基因组核苷酸序列一致性分别为83.7%~89.8%和84.1%~90.0%;基于CP基因的系统进化分析表明,SMYEV分离物分为2个大组群4个亚群,FJ1和FJ2分别归属不同的组,两者具有较远的亲缘关系,其中FJ1与中国分离物sy01和sy04、日本分离物T1以及韩国分离物KNS1亲缘关系最近,FJ2与中国分离物sy02、加拿大一株分离物PEI113_12以及日本分离物T2亲缘关系最近.RDP4重组分析表明,FJ1和FJ2均存在潜在的重组事件.本研究首次报道了我国SMYEV基因组全长序列,为该病毒在我国的侵染流行、检测和防控提供了理论基础.
文献关键词:
草莓;草莓轻型黄边病毒;基因组全长;序列分析
中图分类号:
作者姓名:
江山;陈道;叶立乐;张洁;吴祖建;丁新伦
作者机构:
福建农林大学植物病毒研究所,福建省植物病毒重点实验室,闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室,福州350002
文献出处:
引用格式:
[1]江山;陈道;叶立乐;张洁;吴祖建;丁新伦-.草莓轻型黄边病毒中国分离物全基因组序列测定和分析)[J].病毒学报,2022(05):1187-1194
A类:
Strawberryy,SMYEV,7aa,sy01,sy04,KNS1,sy02,PEI113
B类:
草莓轻型黄边病毒,国分,分离物,全基因组序列,序列测定和分析,mild,yellow,edge,virus,草莓病毒病,侵染,植株,FJ1,FJ2,基因组全长,nt,开放阅读框,ORF4,编码蛋白,序列一致性,CP,系统进化分析,组群,亚群,较远,亲缘关系,加拿大,一株,RDP4,重组分析,首次报道,序列分析
AB值:
0.222776
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