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典型文献
广西猫杯状病毒全基因组序列测定及其遗传进化分析
文献摘要:
为了掌握广西猫杯状病毒(FCV)的流行情况及其变异规律.本研究于2018年3月至2019年9月采集疑似FCV鼻拭子59份,其中阳性检出率49.2%(29/59).将阳性病料接种CRFK细胞,成功分离获得一株FCV毒株,命名为NN01-19.为深入了解其遗传进化规律和分子特征,本研究通过RT-P C R方法扩增获得该毒株的全基因组序列,并对其ORF2基因进行了遗传进化和序列分析.结果表明,NN01-19毒株基因组全长7709 bp,其中ORF2基因全长2010 bp.遗传进化分析发现该毒株与广西早期分离株GX01-13同属基因I群,但核苷酸和氨基酸同源性仅为77.9%和86.5%.其中,超变区(E区)抗原线性表位新增T448A、T450G、G451Q和T454S四个突变位点.重要的是,该区域还发生了V430T的突变,符合VS-FCV致病性氨基酸突变特点.本研究为深入了解FCV的流行特点及其变异规律提供了参考依据,同时也为今后防控FCV提供了重要的理论基础.
文献关键词:
猫杯状病毒;全基因组;ORF2基因;遗传进化分析
作者姓名:
丁仰保;何剑桥;刘林林;余良政;崔柏杨;周华波;韦祖樟;欧阳康;黄伟坚;陈樱
作者机构:
家畜传染病与分子免疫学实验室,广西大学动物科学技术学院,南宁530004;南宁市华波宠物医院,南宁 530004
引用格式:
[1]丁仰保;何剑桥;刘林林;余良政;崔柏杨;周华波;韦祖樟;欧阳康;黄伟坚;陈樱-.广西猫杯状病毒全基因组序列测定及其遗传进化分析)[J].中国动物传染病学报,2022(02):67-73
A类:
NN01,T448A,T450G,G451Q,T454S,V430T
B类:
猫杯状病毒,全基因组序列,序列测定,遗传进化分析,FCV,流行情况,变异规律,鼻拭子,中阳,阳性检出率,CRFK,功分,一株,毒株,进化规律,分子特征,得该,ORF2,序列分析,基因组全长,bp,分离株,GX01,同属,同源性,线性表位,突变位点,VS,致病性,氨基酸突变,流行特点,后防
AB值:
0.277701
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