典型文献
同一猪场的2株基因重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析
文献摘要：
为分析本实验室2017-2018年从同一规模化猪场临床病料中分离的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子遗传特征,本试验采用PCR方法对分离毒株的全基因组进行扩增,并使用分子生物学软件Simplot 3.5.1和RDP 4.24对其进行遗传演化和重组分析.结果显示,分离毒株FJDJQ-2017和FJDJQ-2018基因组全长均为15 016 bp(去除polyA后),2个毒株之间的核苷酸相似性仅为85.8％,与代表性毒株NADC30、QYYZ、VR2332和JXA1的核苷酸同源性分别为92.7％/89.4％、82.8％/84.4％、84.9％/84.7％和 83.2％/84.5％;Nsp2 氨基酸序列分析显示,2 个毒株均存在类 NADC30 毒株特征性的(111+1+19)aa的不连续缺失;基于全基因组遗传演化分析表明,2个毒株均属于谱系1,而基于ORF5基因的进化树分析表明FJDJQ-2017属于谱系3,而FJDJQ-2018属于谱系1;重组分析结果显示,FJDJQ-2017株是以类NADC30毒株为主要亲本毒株,以类QYYZ毒株和类VR2332毒株为次要亲本毒株的重组毒株,而FJDJQ-2018株是以类NADC30毒株为主要亲本毒株,以类QYYZ毒株和类JXA1毒株为次要亲本毒株的重组毒株.本试验结果丰富了 PRRSV重组毒株的基因信息数据库,也为预防和控制猪繁殖与呼吸综合征提供了参考.
文献关键词：
猪繁殖与呼吸综合征病毒;同源性分析;遗传演化;基因重组
中图分类号：
作者姓名：
魏春华;何乐;徐叶;林志锋;刘辰;柳开隆;杨小燕;刘建奎
作者机构：
龙岩学院生命科学学院,福建龙岩364000;福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室,福建龙岩364000;福建农林大学动物科技学院,福建福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]魏春华;何乐;徐叶;林志锋;刘辰;柳开隆;杨小燕;刘建奎-.同一猪场的2株基因重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析)[J].中国兽医杂志,2022(08):7-14
A类：
FJDJQ
B类：
基因重组,猪繁殖与呼吸综合征病毒,遗传演化分析,规模化猪场,PRRSV,分子遗传,遗传特征,全基因组,分子生物学,Simplot,RDP,重组分析,基因组全长,bp,polyA,NADC30,QYYZ,VR2332,JXA1,Nsp2,氨基酸序列,序列分析,特征性,111+1+19,aa,ORF5,进化树分析,亲本,重组毒株,基因信息,信息数据库,预防和控制,同源性分析
AB值：
0.259826
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